More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3775 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 118 aa  240  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  41.96 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  41.96 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  41 
 
 		 117 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.24 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  37.37 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  46.34 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  51.35 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  37.76 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  40.96 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  43.37 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  36.17 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  36.17 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  38.95 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  51.47 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  37.78 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  38.27 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  40.24 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  40.48 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  34.12 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  36.59 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  41.33 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  34.55 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  48.05 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>