More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3729 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 354 aa  737    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  35.01 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1458  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  35.07 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0940503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2847  WD40 domain-containing protein  36.45 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  33.64 
 
 		 944 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1039  WD40 domain-containing protein  33.72 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  31.2 
 
 		 451 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.18 
 
 		 407 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  28.64 
 
 		 432 aa  96.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.09 
 
 		 429 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  34.15 
 
 		 567 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.64 
 
 		 427 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  28.95 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  28.93 
 
 		 441 aa  94  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 443 aa  93.2  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  27.45 
 
 		 443 aa  93.2  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.18 
 
 		 407 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  27.45 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  28.18 
 
 		 435 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  29.11 
 
 		 444 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  30.25 
 
 		 444 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  30.25 
 
 		 444 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  26.34 
 
 		 572 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  31.75 
 
 		 461 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  35.91 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 642 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.7 
 
 		 450 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  26.89 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  34.32 
 
 		 509 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  26.55 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  26.99 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  26.99 
 
 		 434 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  28.4 
 
 		 439 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  26.09 
 
 		 437 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  29.65 
 
 		 461 aa  85.9  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  27.7 
 
 		 437 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  27.84 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  40 
 
 		 629 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.45 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  28.93 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  27.02 
 
 		 440 aa  82.8  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  25.93 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  28.38 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.51 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  30.05 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  27.89 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  29.29 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  24.28 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.35 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.89 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  28.65 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  29.09 
 
 		 1078 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  28.31 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  27.03 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  28.65 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  26.58 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.49 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  26.96 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.49 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  27.23 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.22 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  34.48 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  27.48 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  22.93 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  28.94 
 
 		 648 aa  76.6  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  44.83 
 
 		 620 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  28.7 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  22.82 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  26.7 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  25.79 
 
 		 444 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  49.3 
 
 		 618 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  26.01 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  24.71 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  26.58 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  20.89 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  23.66 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  35.58 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  25.34 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  26.61 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.25 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  26.07 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  27.85 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  26.46 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  25.68 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  25.79 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  29.56 
 
 		 1113 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  28.23 
 
 		 1138 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  27.93 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  30.22 
 
 		 1062 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  26.46 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.42 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  25.79 
 
 		 449 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.73 
 
 		 446 aa  72.8  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  26.03 
 
 		 421 aa  72.8  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.34 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  29.82 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>