More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3601 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  100 
 
 		 163 aa  333  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  44.37 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  44.37 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  44.37 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  46.15 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  43.14 
 
 		 143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  40 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  37.93 
 
 		 141 aa  98.2  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  40.71 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  40.97 
 
 		 145 aa  97.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  42.86 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  43.31 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  39.84 
 
 		 143 aa  95.1  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  40 
 
 		 138 aa  94  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  42.06 
 
 		 142 aa  94  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  41.4 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  39.06 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  39.06 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  40.58 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  39.68 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  40 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  39.42 
 
 		 145 aa  90.9  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  37.69 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  42.65 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  38.52 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  37.68 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  34.78 
 
 		 132 aa  87.4  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  41.98 
 
 		 150 aa  87.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  34.59 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  34.78 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  36 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  38.06 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  35.46 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  39.55 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  34.06 
 
 		 136 aa  85.5  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 132 aa  84.7  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  41.67 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  32.81 
 
 		 145 aa  84  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  34.06 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  36.28 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  36.28 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  35.56 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  35.56 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  39.06 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  38.24 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  37.14 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  36.9 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  32.33 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  29.69 
 
 		 131 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  45.65 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  38.89 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  36.43 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  37.69 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  38.06 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1038  NusB antitermination factor  36.43 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000780031  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  35.34 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  32.73 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  34.35 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  34.11 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  34.35 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0107  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  34.11 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0768  transcription antitermination protein NusB  38.03 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  32.81 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  39.06 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  37.21 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  35.61 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  32.82 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  34.59 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0698  NusB antitermination factor  44.68 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  36.09 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  34.95 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  41.75 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3071  transcription antitermination protein NusB  35.1 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2147  transcription antitermination protein NusB  35.1 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  36.76 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3018  transcription antitermination protein NusB  35.1 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1529  transcription antitermination protein NusB  35.1 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2018  transcription antitermination protein NusB  35.1 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.415369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0762  transcription antitermination protein NusB  35.1 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2595  transcription antitermination protein NusB  35.1 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.694144  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  33.82 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  34.29 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  43.01 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0896  NusB antitermination factor  36.22 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.361769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>