56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3519 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  71.35 
 
 
182 aa  252  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.04771e-07  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  65.5 
 
 
182 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  65.5 
 
 
182 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  65.5 
 
 
182 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  64.33 
 
 
182 aa  224  5e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  62.57 
 
 
182 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  45.4 
 
 
183 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  45.83 
 
 
178 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  42.26 
 
 
181 aa  139  4e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  41.67 
 
 
181 aa  138  5e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  42.86 
 
 
179 aa  137  9e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  42.86 
 
 
179 aa  137  9e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  42.86 
 
 
179 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  41.07 
 
 
177 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  45.4 
 
 
177 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  44.31 
 
 
177 aa  135  6e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  39.88 
 
 
179 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  40.48 
 
 
179 aa  131  8e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  43.18 
 
 
181 aa  130  1e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  38.65 
 
 
165 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.14 
 
 
396 aa  98.6  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  34.15 
 
 
178 aa  95.9  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  35.58 
 
 
160 aa  90.1  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  37.04 
 
 
392 aa  87.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  33.77 
 
 
393 aa  83.6  2e-15  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  32.04 
 
 
178 aa  77.4  1e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.63018e-10  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  29.68 
 
 
190 aa  75.9  4e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  32.04 
 
 
178 aa  75.9  5e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  29.03 
 
 
174 aa  74.3  1e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  30.36 
 
 
175 aa  73.6  2e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  31.14 
 
 
392 aa  71.6  8e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  29.81 
 
 
403 aa  70.5  2e-11  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  33.33 
 
 
393 aa  69.3  4e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  29.19 
 
 
393 aa  68.9  5e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  33.13 
 
 
167 aa  67.4  1e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  28.31 
 
 
170 aa  65.9  4e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  30.25 
 
 
393 aa  64.7  9e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  26.86 
 
 
169 aa  64.7  1e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  27.71 
 
 
170 aa  64.7  1e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  28.32 
 
 
170 aa  63.5  2e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  29.55 
 
 
169 aa  62.4  5e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  27.43 
 
 
169 aa  62  6e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  27.11 
 
 
170 aa  60.8  1e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  27.11 
 
 
170 aa  60.8  1e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  29.75 
 
 
169 aa  60.1  2e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  27.27 
 
 
169 aa  58.9  5e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  26.59 
 
 
171 aa  58.5  6e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  28.1 
 
 
170 aa  58.5  7e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  27.17 
 
 
191 aa  55.8  4e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  28.47 
 
 
167 aa  55.8  5e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  25.43 
 
 
171 aa  55.8  5e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  28.92 
 
 
167 aa  50.8  1e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  28.92 
 
 
167 aa  50.8  1e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  28.92 
 
 
167 aa  50.4  2e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  30.25 
 
 
391 aa  50.1  3e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>