More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3518 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 320 aa  660    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 878 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  35.48 
 
 		 622 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.79 
 
 		 810 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  33.12 
 
 		 764 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.07 
 
 		 820 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 3145 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 649 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  31.14 
 
 		 566 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1827 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.23 
 
 		 706 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 543 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 718 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1276 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  22.61 
 
 		 833 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.18 
 
 		 462 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.68 
 
 		 733 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 909 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.95 
 
 		 875 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 685 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.72 
 
 		 725 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 3560 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.65 
 
 		 746 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 739 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.49 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 639 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  27.49 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.75 
 
 		 689 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 732 aa  76.6  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 968 aa  76.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 		 1252 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 		 1694 aa  76.3  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 637 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 		 1252 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 681 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.99 
 
 		 668 aa  75.9  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.81 
 
 		 887 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  29.38 
 
 		 1154 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 611 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.23 
 
 		 626 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 884 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  23.53 
 
 		 706 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.23 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.75 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.83 
 
 		 818 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.38 
 
 		 784 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.23 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 3301 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  26.23 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 927 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.67 
 
 		 708 aa  74.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.23 
 
 		 626 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 614 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 614 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 3035 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.92 
 
 		 620 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  25.29 
 
 		 992 aa  73.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 637 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 615 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.14 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  24.05 
 
 		 750 aa  73.2  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 635 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 635 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  26.99 
 
 		 1014 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.48 
 
 		 603 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 750 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 632 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 465 aa  72.8  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.65 
 
 		 561 aa  72.4  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.65 
 
 		 561 aa  72.4  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.76 
 
 		 1022 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.49 
 
 		 626 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  26.67 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.89 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 636 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 620 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 1421 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 3172 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.29 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 583 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.38 
 
 		 758 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 750 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 612 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 4489 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  27.69 
 
 		 832 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.5 
 
 		 681 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  28.12 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  28.12 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>