More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3486 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 		 554 aa  643    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 562 aa  721    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 		 554 aa  643    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 		 554 aa  643    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 		 554 aa  643    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  61.94 
 
 		 554 aa  702    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  58.77 
 
 		 567 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 		 566 aa  677    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 		 556 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 		 554 aa  642    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 555 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1350  glutaminyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 777 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0295693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 		 554 aa  643    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 		 569 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  64.56 
 
 		 587 aa  758    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 556 aa  658    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 		 564 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  63.84 
 
 		 570 aa  749    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 559 aa  663    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 555 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  61.17 
 
 		 556 aa  677    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 567 aa  667    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 565 aa  650    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 559 aa  696    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  62.32 
 
 		 561 aa  735    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  63.88 
 
 		 555 aa  722    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 565 aa  741    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 		 566 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  64.62 
 
 		 580 aa  749    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  63.89 
 
 		 572 aa  766    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  61.73 
 
 		 563 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 583 aa  739    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  61.57 
 
 		 553 aa  686    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 		 554 aa  639    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  62.32 
 
 		 568 aa  731    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 		 564 aa  694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 555 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  65.78 
 
 		 570 aa  775    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  58.77 
 
 		 567 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1249  glutaminyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 777 aa  637    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  59.53 
 
 		 565 aa  664    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 569 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  57.61 
 
 		 778 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 561 aa  721    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  63.19 
 
 		 568 aa  747    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 		 557 aa  656    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 567 aa  667    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  62.32 
 
 		 565 aa  732    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 		 559 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  60.78 
 
 		 560 aa  720    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 569 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 582 aa  638    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 705 aa  636    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 		 561 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 		 554 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  57.44 
 
 		 576 aa  661    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 558 aa  694    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  56.29 
 
 		 569 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 557 aa  668    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 556 aa  687    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 565 aa  1180    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 		 555 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  62.25 
 
 		 565 aa  734    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 		 555 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 558 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  56.46 
 
 		 561 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 		 552 aa  638    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 552 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  65.49 
 
 		 569 aa  769    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 		 555 aa  649    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  57.3 
 
 		 540 aa  635    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  61.94 
 
 		 563 aa  731    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 555 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 569 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 589 aa  714    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 		 569 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 556 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03410  glutaminyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 555 aa  639    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 558 aa  670    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  57.74 
 
 		 552 aa  651    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  64.96 
 
 		 564 aa  772    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  58.66 
 
 		 554 aa  643    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 555 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  60.68 
 
 		 565 aa  701    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 		 781 aa  647    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 556 aa  653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 		 554 aa  643    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 569 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1133  glutaminyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 579 aa  634  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.613915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 569 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 551 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 551 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 596 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 569 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 569 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 569 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 573 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 569 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  55.59 
 
 		 569 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  56.29 
 
 		 569 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>