40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3463 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  390  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  55.85 
 
 
190 aa  218  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  57.07 
 
 
190 aa  218  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  56.52 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  54.4 
 
 
191 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  52.2 
 
 
191 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  52.38 
 
 
189 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  55.56 
 
 
171 aa  195  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  52.2 
 
 
191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  52.2 
 
 
191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  49.21 
 
 
188 aa  187  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  48.65 
 
 
189 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  48.54 
 
 
191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  45.98 
 
 
191 aa  160  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  43.33 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  42.22 
 
 
192 aa  144  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  47.86 
 
 
143 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  43.94 
 
 
179 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  35.42 
 
 
196 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  36.3 
 
 
197 aa  94.7  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  35.79 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  32.43 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  40.29 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  39.57 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  36.42 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  35.8 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  38.96 
 
 
180 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  33.16 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  29.65 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  35.21 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  29.73 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  35.92 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  33.56 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  29.02 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  25.93 
 
 
208 aa  64.3  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  51.52 
 
 
169 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.338899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  41.18 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  48.89 
 
 
154 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3277  hypothetical protein  31.13 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>