More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3453 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
184 aa  385  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  64.16 
 
 
197 aa  245  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  62.21 
 
 
184 aa  239  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  63.79 
 
 
181 aa  237  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  60.8 
 
 
183 aa  236  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  57.92 
 
 
186 aa  234  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  60 
 
 
182 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  59.32 
 
 
186 aa  232  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  59.78 
 
 
190 aa  232  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  63.16 
 
 
178 aa  230  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  57.14 
 
 
180 aa  228  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  61.49 
 
 
183 aa  223  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  53.8 
 
 
184 aa  223  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  59.09 
 
 
182 aa  222  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  56.98 
 
 
182 aa  222  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  56.11 
 
 
182 aa  221  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  59.43 
 
 
182 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  59.89 
 
 
195 aa  220  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  58.19 
 
 
177 aa  219  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  55.49 
 
 
180 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  55.19 
 
 
181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  59.66 
 
 
186 aa  216  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  56.32 
 
 
180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  54.55 
 
 
182 aa  214  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  56.5 
 
 
181 aa  213  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  56.5 
 
 
181 aa  213  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  60.69 
 
 
177 aa  213  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  58.05 
 
 
186 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  58.05 
 
 
186 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  58.05 
 
 
186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  53.01 
 
 
183 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  54.91 
 
 
180 aa  211  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
186 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  57.47 
 
 
186 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  57.47 
 
 
186 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  57.49 
 
 
177 aa  210  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  57.47 
 
 
199 aa  209  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  56.15 
 
 
191 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  54.65 
 
 
186 aa  209  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  55.68 
 
 
299 aa  208  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  55.68 
 
 
287 aa  208  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  55.68 
 
 
287 aa  208  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  55.68 
 
 
185 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  55.68 
 
 
185 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  55.68 
 
 
185 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  55.68 
 
 
293 aa  207  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  54.64 
 
 
209 aa  207  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  55.23 
 
 
180 aa  206  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  54.55 
 
 
228 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  54.4 
 
 
277 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 
266 aa  206  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  55.11 
 
 
179 aa  205  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  54.39 
 
 
180 aa  205  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  54.6 
 
 
182 aa  204  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  54.12 
 
 
178 aa  204  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  53.41 
 
 
179 aa  203  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  55.36 
 
 
180 aa  203  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  55.81 
 
 
191 aa  203  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 
201 aa  202  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  49.43 
 
 
176 aa  201  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  52.69 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  52.51 
 
 
178 aa  200  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  53.45 
 
 
211 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  53.63 
 
 
184 aa  200  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  53.45 
 
 
198 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  49.43 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  53.55 
 
 
225 aa  198  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  54.8 
 
 
177 aa  198  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  51.93 
 
 
186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.95 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
185 aa  195  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.33 
 
 
301 aa  194  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  52.91 
 
 
179 aa  193  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  53.14 
 
 
175 aa  193  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  56 
 
 
179 aa  193  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.28 
 
 
301 aa  193  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  49.13 
 
 
179 aa  192  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 
177 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  51.46 
 
 
178 aa  192  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2243  peptide methionine sulfoxide reductase  51.46 
 
 
173 aa  192  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  50.57 
 
 
216 aa  191  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  51.46 
 
 
180 aa  190  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  49.15 
 
 
177 aa  190  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  49.44 
 
 
208 aa  189  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  51.65 
 
 
189 aa  187  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 
242 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.62 
 
 
305 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1950  peptide methionine sulfoxide reductase  49.12 
 
 
173 aa  185  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.88 
 
 
301 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 
228 aa  184  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0289  peptide methionine sulfoxide reductase  50.88 
 
 
175 aa  185  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  49.7 
 
 
175 aa  185  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  47.25 
 
 
210 aa  184  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.35 
 
 
301 aa  184  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.31 
 
 
301 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.31 
 
 
301 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.15 
 
 
302 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.88 
 
 
301 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.88 
 
 
301 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.6 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>