More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3423 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 400 aa  829    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  55.13 
 
 		 402 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  54.87 
 
 		 402 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  52.42 
 
 		 407 aa  432  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  51.9 
 
 		 409 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  51.96 
 
 		 399 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  51.03 
 
 		 404 aa  415  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  53.08 
 
 		 404 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  48.44 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  50.13 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  47.93 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  46.41 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  47.84 
 
 		 394 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  44.62 
 
 		 403 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  47.8 
 
 		 403 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  44.1 
 
 		 397 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  46.29 
 
 		 398 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  43.85 
 
 		 409 aa  349  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  45.84 
 
 		 422 aa  348  8e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  45.84 
 
 		 422 aa  348  8e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  45.94 
 
 		 396 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  45.84 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  45.84 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  45.94 
 
 		 396 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  43.59 
 
 		 398 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  41.41 
 
 		 407 aa  346  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  43.65 
 
 		 410 aa  345  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  44.62 
 
 		 398 aa  345  7e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  45.69 
 
 		 406 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  43.65 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  45.59 
 
 		 422 aa  343  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  45.34 
 
 		 422 aa  342  5e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  45.34 
 
 		 422 aa  342  7e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  45.34 
 
 		 422 aa  342  7e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  43.75 
 
 		 416 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  42.82 
 
 		 427 aa  342  9e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  43.75 
 
 		 416 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  45.59 
 
 		 422 aa  341  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.75 
 
 		 390 aa  341  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  43.85 
 
 		 625 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.51 
 
 		 396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  42.12 
 
 		 427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  43.23 
 
 		 416 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  45.12 
 
 		 425 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  47.34 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  40.89 
 
 		 399 aa  333  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 412 aa  333  4e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  46.45 
 
 		 406 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  44.33 
 
 		 422 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  44.33 
 
 		 422 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  44.33 
 
 		 422 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  44.25 
 
 		 422 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  44.08 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  46.91 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  44.5 
 
 		 400 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  41.3 
 
 		 403 aa  322  7e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  44.33 
 
 		 396 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  45.29 
 
 		 403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  39.95 
 
 		 410 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  42.33 
 
 		 401 aa  317  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  39.95 
 
 		 408 aa  315  7e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  41.98 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  39.59 
 
 		 416 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  43.65 
 
 		 408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  42.44 
 
 		 402 aa  295  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  42.56 
 
 		 245 aa  199  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 408 aa  199  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  34.09 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 		 405 aa  196  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  34.34 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 399 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  31.17 
 
 		 368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 496 aa  144  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 369 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 367 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 369 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 369 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.23 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.31 
 
 		 373 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 373 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 373 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 375 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.98 
 
 		 373 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.98 
 
 		 373 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.98 
 
 		 373 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.98 
 
 		 373 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>