More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3386 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 482 aa  956    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  37.83 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  39.72 
 
 		 452 aa  266  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  34.55 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  34.43 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  33.94 
 
 		 452 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  29.51 
 
 		 445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.66 
 
 		 485 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  32.4 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  32.29 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  29.59 
 
 		 473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  29.69 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 469 aa  159  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 499 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  28.86 
 
 		 580 aa  151  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  27.22 
 
 		 522 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  29.18 
 
 		 447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  27.73 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  27.73 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  27.73 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  27.73 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  27.73 
 
 		 437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  27.73 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  27.49 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  27.73 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  31.47 
 
 		 439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  28.54 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  26.72 
 
 		 609 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  30.32 
 
 		 495 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 472 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  27.14 
 
 		 443 aa  123  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  27.75 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  27.16 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  25.19 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  26.63 
 
 		 480 aa  99.8  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  25.82 
 
 		 382 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 436 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  27.25 
 
 		 440 aa  97.1  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 786 aa  96.3  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  25.48 
 
 		 411 aa  94  6e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01631  methionine transporter (Eurofung)  28.2 
 
 		 540 aa  93.6  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.281549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 429 aa  93.6  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 		 770 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.41 
 
 		 489 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 		 455 aa  90.5  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 		 445 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 515 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  23.44 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69488  high affinity methionine permease  25.42 
 
 		 551 aa  88.2  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.649926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  29.82 
 
 		 460 aa  87  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  25.58 
 
 		 512 aa  86.7  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  23.8 
 
 		 520 aa  86.7  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 745 aa  86.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09300  amino acid transporter (Eurofung)  23.14 
 
 		 614 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917977  normal  0.922161 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2830  amino acid permease family protein  27.51 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 716 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  24.35 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 764 aa  83.2  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  25.55 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  23.23 
 
 		 452 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  27.22 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  30.15 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  22.14 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  28.89 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  27.36 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  27.36 
 
 		 462 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  27.36 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  27.36 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  27.36 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  24.2 
 
 		 503 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  27.36 
 
 		 462 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>