42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3352 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  100 
 
 
578 aa  1189  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  42.99 
 
 
538 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  43.91 
 
 
538 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  42.52 
 
 
538 aa  363  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  40.81 
 
 
536 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  43.06 
 
 
453 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  42.19 
 
 
459 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  43.1 
 
 
432 aa  340  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  40.96 
 
 
469 aa  340  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  41.59 
 
 
458 aa  338  1e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  43.57 
 
 
432 aa  337  2e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  42.89 
 
 
456 aa  329  1e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  40.09 
 
 
480 aa  328  2e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  40.52 
 
 
478 aa  323  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  38.28 
 
 
441 aa  316  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  38.7 
 
 
468 aa  306  8e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16786e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  38.53 
 
 
519 aa  306  8e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  38.33 
 
 
435 aa  286  6e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  38.15 
 
 
434 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  35.6 
 
 
452 aa  281  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  37.29 
 
 
436 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  37.29 
 
 
436 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  35.2 
 
 
441 aa  274  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  35.21 
 
 
435 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  36.47 
 
 
436 aa  270  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  36.17 
 
 
499 aa  266  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  33.57 
 
 
440 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  35.62 
 
 
470 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  32.87 
 
 
472 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  35.7 
 
 
427 aa  252  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  32.37 
 
 
438 aa  244  2e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  32.61 
 
 
466 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  32.37 
 
 
466 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  31.98 
 
 
466 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  31.49 
 
 
460 aa  235  1e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  31.49 
 
 
460 aa  235  2e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  31.49 
 
 
460 aa  235  2e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  32.37 
 
 
466 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  32.37 
 
 
466 aa  234  4e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  32.37 
 
 
466 aa  234  4e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  31.89 
 
 
460 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  31.12 
 
 
437 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>