More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3343 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  100 
 
 		 338 aa  691    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  47.73 
 
 		 323 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  47.13 
 
 		 323 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  46.99 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  41.36 
 
 		 373 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  48.25 
 
 		 337 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  42.55 
 
 		 331 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  41.49 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  39.32 
 
 		 311 aa  222  6e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  39.58 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 329 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  40.77 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  42.02 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  41.37 
 
 		 278 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  37.65 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  40 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 318 aa  188  9e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 498 aa  188  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 		 472 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1586  glutamyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.81 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 		 464 aa  182  7e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  40.88 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4042  Glutamate--tRNA ligase  38.72 
 
 		 285 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 468 aa  179  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 482 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 466 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 465 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 465 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 466 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 469 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2388  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  41.11 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 466 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  39.53 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 469 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 470 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5322  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.27 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  35.19 
 
 		 518 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 471 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4941  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.58 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5029  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.58 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  38.31 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 535 aa  172  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 470 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 477 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 881 aa  172  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  40.22 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 492 aa  172  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 467 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  40.13 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 469 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 467 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 469 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 481 aa  170  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 		 478 aa  170  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 469 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 491 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 504 aa  169  5e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 467 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 492 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 467 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  37.65 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 469 aa  169  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 465 aa  169  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 490 aa  169  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 469 aa  169  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 485 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 463 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 469 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 474 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 469 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 467 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 469 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 473 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 494 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 471 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 471 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  38.63 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 464 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 470 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 471 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 		 462 aa  166  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 480 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 475 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 487 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  34.82 
 
 		 310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 474 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1690  glutamyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 		 468 aa  165  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.863945 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 		 484 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  38.2 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 496 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>