More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3302 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 591 aa  662    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 594 aa  641    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 591 aa  662    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 591 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 591 aa  662    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 591 aa  659    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 593 aa  648    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 592 aa  637    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 591 aa  647    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 585 aa  636    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 594 aa  646    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 591 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 593 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 594 aa  645    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 590 aa  641    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 598 aa  653    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 591 aa  661    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 603 aa  636    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 597 aa  635    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 		 597 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 597 aa  636    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 589 aa  668    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 600 aa  641    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 592 aa  652    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 589 aa  1216    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 594 aa  660    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 594 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 593 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 591 aa  662    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 595 aa  648    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 591 aa  662    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 593 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 597 aa  628  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 601 aa  627  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 596 aa  625  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 589 aa  625  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 608 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 589 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 588 aa  622  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 590 aa  624  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 		 588 aa  624  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 598 aa  624  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 588 aa  621  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 588 aa  621  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 602 aa  621  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 627 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 597 aa  611  1e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 597 aa  610  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 613 aa  610  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 619 aa  611  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 598 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 594 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 587 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 594 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 586 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 587 aa  600  1e-170  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 599 aa  599  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 590 aa  596  1e-169  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 606 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 593 aa  593  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 600 aa  593  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 594 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 583 aa  589  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 593 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 601 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 588 aa  590  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 600 aa  590  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 614 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0111  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 616 aa  590  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 617 aa  591  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 610 aa  591  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 599 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01940  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 582 aa  585  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.425315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 598 aa  587  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 582 aa  585  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 582 aa  587  1e-166  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4233  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 581 aa  585  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0829  aspartyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 582 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0763461  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 598 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 599 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4606  aspartyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 589 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 600 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 594 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 599 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 595 aa  582  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 583 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 598 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 596 aa  579  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 592 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4178  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 589 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 602 aa  581  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 601 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1067  aspartyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 587 aa  580  1e-164  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 597 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 592 aa  580  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 591 aa  578  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1309  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 591 aa  579  1e-164  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 605 aa  579  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 623 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>