More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3277 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  100 
 
 
554 aa  1138    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  46.94 
 
 
571 aa  475  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  44.19 
 
 
561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  44.19 
 
 
561 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  43.68 
 
 
543 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  44.68 
 
 
566 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  42.56 
 
 
560 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  44.6 
 
 
557 aa  450  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  42.78 
 
 
561 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  42.61 
 
 
561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  46.17 
 
 
559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  44.62 
 
 
540 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.65 
 
 
550 aa  438  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  38.15 
 
 
574 aa  436  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  43.37 
 
 
573 aa  438  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  45.49 
 
 
556 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.32 
 
 
577 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  42.11 
 
 
584 aa  435  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  45.26 
 
 
567 aa  434  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2239  NAD synthetase  45.99 
 
 
558 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.572998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  40.65 
 
 
546 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  44.25 
 
 
567 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  45.81 
 
 
574 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  45.05 
 
 
548 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39.83 
 
 
566 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  39.41 
 
 
566 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  42.21 
 
 
564 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.88 
 
 
556 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18451  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  41.78 
 
 
569 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.522379 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  38.97 
 
 
566 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0977  NAD+ synthase  41.78 
 
 
569 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  40.57 
 
 
554 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  40.42 
 
 
558 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  44.6 
 
 
543 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  42.31 
 
 
539 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  39.05 
 
 
583 aa  412  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  42.53 
 
 
583 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  42.6 
 
 
552 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  41.52 
 
 
576 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1539  NAD+ synthetase  38.84 
 
 
565 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  41.59 
 
 
561 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16481  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  38.31 
 
 
565 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  39.93 
 
 
576 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  39.93 
 
 
576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0495  NAD+ synthase  43.54 
 
 
558 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2180  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.04 
 
 
561 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  41.59 
 
 
539 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.6 
 
 
577 aa  405  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  40.82 
 
 
565 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  40.87 
 
 
538 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  37.5 
 
 
573 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  38.54 
 
 
575 aa  402  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16361  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  38.74 
 
 
565 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16251  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  38.05 
 
 
565 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.13 
 
 
535 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  41.11 
 
 
562 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  39.71 
 
 
567 aa  395  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  39.53 
 
 
567 aa  394  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  40.47 
 
 
540 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  38.24 
 
 
545 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  41.08 
 
 
538 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  41.74 
 
 
576 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  40.93 
 
 
587 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  42.78 
 
 
539 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04891  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  44.13 
 
 
564 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  41.7 
 
 
557 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  40.96 
 
 
559 aa  392  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  42.78 
 
 
550 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  40.25 
 
 
552 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  39.93 
 
 
540 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  40.65 
 
 
571 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  40.39 
 
 
546 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  39.93 
 
 
540 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  41.06 
 
 
542 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  41.1 
 
 
583 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  40.86 
 
 
545 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0285  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.79 
 
 
569 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210766  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  40.11 
 
 
540 aa  388  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  39.89 
 
 
542 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  40.18 
 
 
550 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  39.71 
 
 
542 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  40.32 
 
 
545 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  38.17 
 
 
545 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  39.9 
 
 
584 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  39.96 
 
 
540 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  39.75 
 
 
556 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1593  NAD synthetase  41.06 
 
 
554 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635718  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  40.32 
 
 
587 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  40.71 
 
 
569 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2333  NAD synthetase  41.48 
 
 
554 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.51 
 
 
543 aa  382  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.77 
 
 
559 aa  382  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  40 
 
 
550 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1008  NAD synthetase  41.65 
 
 
554 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0307  NAD+ synthetase  43.62 
 
 
569 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.770204  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  38.88 
 
 
559 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  40.78 
 
 
554 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  38.31 
 
 
552 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  40.43 
 
 
554 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  38.68 
 
 
560 aa  375  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>