More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3217 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 576 aa  1178    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  30.87 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  33.72 
 
 		 560 aa  213  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  47.21 
 
 		 1046 aa  212  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1406 aa  209  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 827 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  37.88 
 
 		 508 aa  203  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 645 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  35.55 
 
 		 835 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  42.24 
 
 		 1392 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 1303 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  40.6 
 
 		 461 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 		 1155 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  32.12 
 
 		 561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 		 1214 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.32 
 
 		 923 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  40.4 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 		 1155 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  33.82 
 
 		 833 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  31.91 
 
 		 800 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 763 aa  196  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 568 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 818 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.29 
 
 		 918 aa  194  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.46 
 
 		 818 aa  194  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1163 aa  194  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  34.57 
 
 		 1133 aa  194  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 1145 aa  193  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  39.73 
 
 		 461 aa  193  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 977 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 782 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 		 858 aa  192  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.95 
 
 		 1203 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  37.96 
 
 		 1172 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 		 1119 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 932 aa  191  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  35.16 
 
 		 932 aa  190  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  40.44 
 
 		 1695 aa  190  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 		 687 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 577 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 		 1159 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 		 1937 aa  190  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 404 aa  190  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.17 
 
 		 932 aa  189  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.72 
 
 		 1816 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 921 aa  189  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 1149 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  36.49 
 
 		 925 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  42.8 
 
 		 556 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 1155 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 640 aa  189  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 1857 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 		 1159 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  39.21 
 
 		 1170 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1839 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  38.76 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 456 aa  188  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 371 aa  188  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 574 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1942 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 627 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 		 1352 aa  188  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  38.25 
 
 		 845 aa  187  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  36.8 
 
 		 1001 aa  187  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.13 
 
 		 1917 aa  187  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1482 aa  187  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 646 aa  187  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 667 aa  187  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  35 
 
 		 937 aa  186  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 569 aa  186  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  37.35 
 
 		 998 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 1356 aa  186  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1155 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 575 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  36.39 
 
 		 925 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 		 1977 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.65 
 
 		 823 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  31.03 
 
 		 572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 956 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  35.44 
 
 		 917 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  33.6 
 
 		 554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434752 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 395 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 631 aa  185  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  38.31 
 
 		 603 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  35.63 
 
 		 2051 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  43.48 
 
 		 882 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.77 
 
 		 928 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.49 
 
 		 1499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  40.94 
 
 		 736 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 		 846 aa  184  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.93 
 
 		 929 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 919 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.69 
 
 		 927 aa  184  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1406 aa  183  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 446 aa  183  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  37.85 
 
 		 1137 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.59 
 
 		 921 aa  183  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  39.22 
 
 		 565 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.77 
 
 		 931 aa  183  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>