More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3191 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3191  tryptophan synthase, beta subunit  100 
 
 		 405 aa  842    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  63.4 
 
 		 409 aa  528  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.37 
 
 		 409 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  60.83 
 
 		 411 aa  522  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  63.59 
 
 		 402 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  61.24 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  62.03 
 
 		 396 aa  521  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  61.76 
 
 		 397 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  63.31 
 
 		 394 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  61.24 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2688  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 408 aa  513  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  61.3 
 
 		 401 aa  514  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  60.99 
 
 		 404 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  62.05 
 
 		 396 aa  511  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 399 aa  508  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 399 aa  510  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 399 aa  510  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 396 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 394 aa  508  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 400 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 		 406 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  59.26 
 
 		 410 aa  508  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 422 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 403 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 397 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 404 aa  507  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 399 aa  508  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 405 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  61.7 
 
 		 399 aa  502  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 395 aa  503  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  61.76 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 391 aa  501  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 412 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 		 405 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 414 aa  501  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 404 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 406 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 397 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 428 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 401 aa  501  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  61.85 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  61.11 
 
 		 420 aa  499  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  59.12 
 
 		 413 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  59.5 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  57.68 
 
 		 424 aa  498  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 405 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  58.09 
 
 		 411 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  59.22 
 
 		 405 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  59.48 
 
 		 409 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 409 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  57.43 
 
 		 424 aa  495  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  58.99 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 410 aa  497  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  58.69 
 
 		 435 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  59.24 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  59.64 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  58.99 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  59.22 
 
 		 405 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>