244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3188 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3188  amidohydrolase  100 
 
 		 598 aa  1224    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  30.29 
 
 		 413 aa  122  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  29.31 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  29.02 
 
 		 428 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  30.33 
 
 		 414 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  30.02 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  28.74 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  30.28 
 
 		 420 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  27.84 
 
 		 373 aa  111  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  30.61 
 
 		 368 aa  110  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  31.07 
 
 		 421 aa  107  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0371  chlorohydrolase  26.59 
 
 		 405 aa  103  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0102343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  29.86 
 
 		 428 aa  103  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  29.18 
 
 		 424 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  30.23 
 
 		 388 aa  100  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  31.42 
 
 		 299 aa  100  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.85 
 
 		 484 aa  97.1  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0362  chlorohydrolase  25.4 
 
 		 404 aa  97.1  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0746699  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.85 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0441  amidohydrolase  23.42 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  26.51 
 
 		 420 aa  92  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  27.07 
 
 		 392 aa  89.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0289  amidohydrolase  27.6 
 
 		 408 aa  88.2  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3845  amidohydrolase  23.94 
 
 		 392 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1504  chlorohydrolase  23.6 
 
 		 406 aa  87.4  8e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  22.82 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  26.32 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  26.48 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0229  chlorohydrolase  24.13 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.02 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0064  chlorohydrolase  23.71 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  27.98 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  22.83 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  27.11 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0105  chlorohydrolase  24.1 
 
 		 409 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0549  amidohydrolase  26.22 
 
 		 425 aa  80.1  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000560695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0399  amidohydrolase  28.53 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.408969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  25.13 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  25.13 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.4 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0398  amidohydrolase  28.67 
 
 		 412 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  24.23 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.07 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  22.52 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  22.34 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.23 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  22.62 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.99 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.1 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.33 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  22.34 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  24.27 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1874  amidohydrolase  26.35 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  24.41 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.9 
 
 		 439 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  24.44 
 
 		 440 aa  73.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0077  chlorohydrolase  23.49 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  22.76 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.59 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1566  amidohydrolase  22.63 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  24.42 
 
 		 432 aa  72  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.87 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8785  amidohydrolase  28.14 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0686  chlorohydrolase  22.39 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.777216  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.86 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  25.82 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  25.22 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.14 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1645  amidohydrolase  24.52 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4208  amidohydrolase  25.86 
 
 		 416 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00909299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  28.77 
 
 		 442 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  22.99 
 
 		 434 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39210  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.67 
 
 		 437 aa  70.1  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  0.540692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  22.77 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  26.75 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.86 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  25.25 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1212  chlorohydrolase  21.76 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1846  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.63 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  26.7 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0758  amidohydrolase  26.64 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  26.05 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  24.93 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.93 
 
 		 441 aa  67  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  27.36 
 
 		 443 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  24.15 
 
 		 426 aa  66.6  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0370  amidohydrolase 1  27.5 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  26.39 
 
 		 421 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  23.96 
 
 		 660 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  26.29 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  25.97 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2445  amidohydrolase  24.2 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  25.16 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  27.56 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2149  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.78 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.450112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  28.86 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0532  amidohydrolase  24.73 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2494  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.79 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.96 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  21.78 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>