More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3166 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  100 
 
 		 240 aa  486  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  61.82 
 
 		 230 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  60.36 
 
 		 234 aa  278  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  57.89 
 
 		 231 aa  276  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  59.65 
 
 		 231 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  60.26 
 
 		 232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  57.27 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  56.25 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  60.54 
 
 		 232 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  56.64 
 
 		 228 aa  269  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  60.09 
 
 		 232 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  58.37 
 
 		 235 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  59.46 
 
 		 230 aa  267  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  56.58 
 
 		 231 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  56.95 
 
 		 229 aa  265  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  60 
 
 		 232 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  60 
 
 		 232 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  59.64 
 
 		 232 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  59.65 
 
 		 232 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  56.19 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  59.09 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  53.78 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  55.75 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  60 
 
 		 232 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  57.21 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  58.48 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  50 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  50 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.1 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  49.34 
 
 		 234 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  48.85 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.8 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  51.36 
 
 		 252 aa  218  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.71 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.24 
 
 		 222 aa  215  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.12 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.07 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  45.37 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.96 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  46.22 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  46.35 
 
 		 388 aa  208  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.96 
 
 		 266 aa  208  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  50.68 
 
 		 231 aa  208  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.07 
 
 		 247 aa  208  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 252 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 231 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  48.83 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.15 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  47.71 
 
 		 388 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  48.4 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.66 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49.36 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.49 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.06 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  45.16 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  50.47 
 
 		 291 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  44.34 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  44.29 
 
 		 235 aa  205  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  50 
 
 		 312 aa  205  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.82 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 249 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.54 
 
 		 252 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.58 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.79 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.22 
 
 		 225 aa  204  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 227 aa  204  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.26 
 
 		 226 aa  204  9e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.36 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.36 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  44.98 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  51.61 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  48.15 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  50.23 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>