96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3105 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  100 
 
 
432 aa  863    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  33.66 
 
 
362 aa  63.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  32.32 
 
 
280 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  31.31 
 
 
312 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  36.56 
 
 
602 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  33.33 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  35.53 
 
 
313 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  35.53 
 
 
313 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  25.66 
 
 
244 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  30.63 
 
 
235 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  35.53 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1450  abortive infection protein  32.35 
 
 
336 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101728  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  31.58 
 
 
337 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  35.53 
 
 
337 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1471  hypothetical protein  27.74 
 
 
311 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  28.93 
 
 
249 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  28.28 
 
 
297 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  24.9 
 
 
253 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  26.42 
 
 
249 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  37.63 
 
 
225 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  34.21 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  34.21 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  30.63 
 
 
249 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  30.63 
 
 
249 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  34.21 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  30.63 
 
 
249 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  34.21 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  30.63 
 
 
249 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  37.63 
 
 
226 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  34.21 
 
 
337 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  29.21 
 
 
267 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  29.73 
 
 
249 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  34.69 
 
 
281 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  27.97 
 
 
249 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  35.48 
 
 
225 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  36 
 
 
241 aa  53.5  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  37.63 
 
 
225 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  28.8 
 
 
264 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  28.47 
 
 
306 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  30.19 
 
 
338 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  32.22 
 
 
241 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  32.94 
 
 
244 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  33.03 
 
 
235 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  26.6 
 
 
321 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  29.46 
 
 
250 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  31.58 
 
 
274 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0770  abortive infection protein  41.54 
 
 
262 aa  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  36.56 
 
 
140 aa  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  30.84 
 
 
775 aa  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  24.63 
 
 
261 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  27.81 
 
 
308 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  27.56 
 
 
273 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0845  abortive infection protein  28.99 
 
 
272 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  29.2 
 
 
237 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  31.15 
 
 
273 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  24.06 
 
 
237 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  27.94 
 
 
299 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5053  CAAX amino terminal protease family protein  36.78 
 
 
225 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  29.59 
 
 
234 aa  47.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  34.41 
 
 
226 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  35.48 
 
 
216 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  35.9 
 
 
273 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  35.48 
 
 
216 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  24.32 
 
 
288 aa  46.6  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  29.81 
 
 
282 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  28.85 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  27.88 
 
 
308 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  28.85 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  28.85 
 
 
282 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  27.74 
 
 
299 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  29.46 
 
 
246 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  32.53 
 
 
284 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  28.85 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  28.85 
 
 
284 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  28.37 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  21.93 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
237 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  31.11 
 
 
237 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  25.93 
 
 
237 aa  45.1  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  32.41 
 
 
830 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  32.53 
 
 
284 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  31.13 
 
 
289 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  31.11 
 
 
288 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  31.11 
 
 
236 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  32.53 
 
 
282 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  26.09 
 
 
302 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  31.11 
 
 
236 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  31.11 
 
 
236 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  32.26 
 
 
225 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  27.78 
 
 
267 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  27.73 
 
 
269 aa  43.5  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  31.68 
 
 
221 aa  43.5  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  21.46 
 
 
308 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
237 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  30.68 
 
 
246 aa  43.1  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
227 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>