More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3061 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 863 aa  1765    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 1048 aa  260  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 1010 aa  241  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  35.31 
 
 		 919 aa  234  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.45 
 
 		 1152 aa  232  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.76 
 
 		 1514 aa  228  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.55 
 
 		 1514 aa  227  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 1003 aa  227  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  33.97 
 
 		 1299 aa  224  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 1013 aa  220  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 1361 aa  219  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  33.33 
 
 		 1366 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1002 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 1385 aa  217  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 1415 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1559 aa  216  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  34.09 
 
 		 1156 aa  213  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 1153 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  33.87 
 
 		 1172 aa  212  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 1383 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 		 1426 aa  210  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 1431 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 1118 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 1390 aa  208  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 1390 aa  208  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 1140 aa  207  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 1406 aa  207  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1390 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 1645 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 975 aa  205  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 1631 aa  204  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1287 aa  204  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  31.51 
 
 		 1427 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1248 aa  202  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 1131 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 979 aa  201  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 1711 aa  201  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.63 
 
 		 1180 aa  201  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.13 
 
 		 1051 aa  198  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  33.25 
 
 		 1311 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 1370 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 1383 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 1651 aa  197  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 1646 aa  197  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  30.75 
 
 		 816 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 837 aa  191  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  31.42 
 
 		 1202 aa  191  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  30.52 
 
 		 816 aa  190  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  28.91 
 
 		 1127 aa  189  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.27 
 
 		 1301 aa  189  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 978 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  28.79 
 
 		 1340 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  29.69 
 
 		 993 aa  186  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  30.97 
 
 		 1343 aa  185  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  30.51 
 
 		 1344 aa  180  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 443 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  29.55 
 
 		 1366 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 442 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  30.09 
 
 		 1378 aa  177  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 781 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  28.31 
 
 		 1374 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.8 
 
 		 1193 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  27.79 
 
 		 1347 aa  175  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  33.18 
 
 		 663 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  28.89 
 
 		 1418 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  30.21 
 
 		 1111 aa  174  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1128 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2565  histidine kinase  38.31 
 
 		 442 aa  174  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  30.32 
 
 		 1355 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  29.4 
 
 		 1378 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 904 aa  172  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1297 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  28.48 
 
 		 1373 aa  172  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  29.03 
 
 		 876 aa  171  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 1096 aa  171  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  28.54 
 
 		 1298 aa  171  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.7 
 
 		 1177 aa  170  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 445 aa  170  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.124248  normal  0.045206 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  27.57 
 
 		 1376 aa  170  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  25.84 
 
 		 1384 aa  170  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  29.53 
 
 		 1306 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2814  sensor histidine kinase  36.78 
 
 		 443 aa  169  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2736  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.45 
 
 		 442 aa  168  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 934 aa  168  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 462 aa  168  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.894513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 		 1274 aa  167  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 		 1070 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 823 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 445 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238926  normal  0.0632416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 407 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 437 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2692  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 445 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 		 803 aa  166  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 677 aa  165  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 440 aa  165  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  31.36 
 
 		 588 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 1179 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  28.42 
 
 		 1526 aa  164  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  30.79 
 
 		 661 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>