57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2995 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2995  Nuz  100 
 
 		 279 aa  576  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.234829  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26345  predicted protein  36.43 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2725  ribonuclease Z family protein  33.33 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399344  normal  0.100634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0220  hypothetical protein  29.66 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3827  hypothetical protein  25.72 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0893  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0178503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0063  ribonuclease Z  31.16 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.253794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0063  ribonuclease Z  30.8 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.715887  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0562  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25.51 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1423  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.408877  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  25.22 
 
 		 314 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 583 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  24.78 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  24.14 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 556 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  24.89 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 		 556 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 		 556 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 		 556 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 		 556 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 		 556 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 		 556 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 		 556 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 		 556 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 556 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  25 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  25.52 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  27.83 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  22.91 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  32.61 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  32.61 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  29.52 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  32.61 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  32.61 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  32.61 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  32.61 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  32.61 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  32.61 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  32.61 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  24.68 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  26.77 
 
 		 287 aa  45.8  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  24.38 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  26.91 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  24.47 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.97 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  29.32 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  25.34 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  25.48 
 
 		 313 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  25 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  26.16 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 341 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 341 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>