More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2969 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  100 
 
 		 623 aa  1283    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  50.37 
 
 		 287 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  49.45 
 
 		 282 aa  267  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  49.63 
 
 		 287 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  47.48 
 
 		 282 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  49.46 
 
 		 287 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1252  rhodanese superfamily protein  49.46 
 
 		 287 aa  259  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  43.2 
 
 		 352 aa  256  9e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2080  rhodanese superfamily protein  48.91 
 
 		 327 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0163849  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  42.18 
 
 		 352 aa  251  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  46.5 
 
 		 334 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  43.84 
 
 		 333 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  46.04 
 
 		 282 aa  247  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  47.27 
 
 		 284 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0983  rhodanese superfamily protein  47.27 
 
 		 333 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2337  rhodanese superfamily protein  47.25 
 
 		 284 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0128371 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1914  rhodanese superfamily protein  46.18 
 
 		 299 aa  244  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0325  rhodanese superfamily protein  46.18 
 
 		 299 aa  244  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1354  rhodanese superfamily protein  46.18 
 
 		 299 aa  244  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1196  rhodanese superfamily protein  46.18 
 
 		 299 aa  244  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.760929  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0826  rhodanese superfamily protein  46.18 
 
 		 299 aa  244  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56708  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1042  rhodanese superfamily protein  46.18 
 
 		 299 aa  244  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1204  rhodanese superfamily protein  46.18 
 
 		 299 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521116  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  42.81 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2233  rhodanese superfamily protein  46.52 
 
 		 284 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2353  rhodanese superfamily protein  46.52 
 
 		 284 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0478331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  42.81 
 
 		 330 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  42.47 
 
 		 333 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0963  rhodanese superfamily protein  45.79 
 
 		 339 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.197829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  40.99 
 
 		 336 aa  238  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0484  rhodanese domain-containing protein  48.81 
 
 		 260 aa  238  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  42.46 
 
 		 334 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  43.82 
 
 		 305 aa  236  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  41.7 
 
 		 334 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  42.4 
 
 		 350 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  40.75 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  41.7 
 
 		 334 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  40.75 
 
 		 326 aa  234  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  42.66 
 
 		 304 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  40.75 
 
 		 334 aa  234  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5656  rhodanese superfamily protein  46.3 
 
 		 284 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  40.64 
 
 		 337 aa  233  9e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  42.66 
 
 		 302 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  40.99 
 
 		 323 aa  232  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  41.7 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  43.9 
 
 		 322 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  40.99 
 
 		 323 aa  231  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  41.1 
 
 		 326 aa  231  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  40.41 
 
 		 327 aa  230  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1325  Rhodanese domain protein  48.02 
 
 		 258 aa  230  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00765763  hitchhiker  1.3347e-18 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  40.99 
 
 		 314 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  40.07 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  43.84 
 
 		 317 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  42.4 
 
 		 310 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  40.27 
 
 		 326 aa  228  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  40.99 
 
 		 317 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  42.4 
 
 		 339 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  42.05 
 
 		 310 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  41.05 
 
 		 309 aa  227  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  42.56 
 
 		 306 aa  226  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  39.04 
 
 		 332 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  42.21 
 
 		 305 aa  225  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  40.07 
 
 		 332 aa  225  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  40.99 
 
 		 314 aa  225  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  38.49 
 
 		 328 aa  224  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 305 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  40.99 
 
 		 312 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  40.69 
 
 		 341 aa  224  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  42.21 
 
 		 308 aa  224  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  40.28 
 
 		 317 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  41.7 
 
 		 310 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  40.13 
 
 		 316 aa  224  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  39.59 
 
 		 326 aa  223  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  41.34 
 
 		 310 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  42.61 
 
 		 311 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  40.28 
 
 		 294 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  39.73 
 
 		 312 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 		 312 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  39.07 
 
 		 326 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  38.7 
 
 		 326 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2926  rhodanese superfamily protein  48.52 
 
 		 253 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  39.73 
 
 		 312 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0683  rhodanese superfamily protein  47.93 
 
 		 248 aa  217  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.463149  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0473  rhodanese-related sulfurtransferase  46.38 
 
 		 237 aa  217  5e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4043  rhodanese domain-containing protein  46.59 
 
 		 263 aa  217  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0638463 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1694  putative sulfurtransferase  45.96 
 
 		 237 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  39.73 
 
 		 299 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  39.86 
 
 		 309 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2894  rhodanese superfamily protein  47.46 
 
 		 261 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  40.49 
 
 		 309 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  38.13 
 
 		 316 aa  212  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  41.3 
 
 		 319 aa  211  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  39.93 
 
 		 305 aa  211  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3026  rhodanese domain-containing protein  48.76 
 
 		 257 aa  211  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3119  Rhodanese domain protein  47.3 
 
 		 263 aa  210  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  35.88 
 
 		 319 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  41.47 
 
 		 315 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  35.55 
 
 		 319 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  38.25 
 
 		 322 aa  206  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  39.1 
 
 		 301 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>