More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2927 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 96 aa  186  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  67.78 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  60.82 
 
 		 97 aa  120  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  61.54 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  67.39 
 
 		 98 aa  120  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  64.44 
 
 		 94 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 		 98 aa  120  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  64.13 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  64.13 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  64.13 
 
 		 94 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  117  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 98 aa  117  7.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 95 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  62.22 
 
 		 94 aa  113  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 97 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 96 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  61.96 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  61.11 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2230  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 		 93 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  60 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  60.22 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 104 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  54.35 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 105 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 97 aa  110  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  54.35 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  58.89 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  54.35 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  56.52 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  60.44 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  62.64 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  53.26 
 
 		 97 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  54.35 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  53.12 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  52.17 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  54.95 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  53.26 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  54.17 
 
 		 96 aa  107  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 96 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 105 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  54.17 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 		 95 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  53.26 
 
 		 95 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  53.68 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3627  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  105  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>