71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2912 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  100 
 
 
268 aa  539  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  51.3 
 
 
1072 aa  235  5.0000000000000005e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  47.14 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.5 
 
 
221 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  39.23 
 
 
249 aa  181  9.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  38.39 
 
 
236 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  32.66 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  35 
 
 
479 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  35.4 
 
 
648 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  31.89 
 
 
262 aa  122  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  30.27 
 
 
260 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  31.46 
 
 
593 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  31.19 
 
 
593 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1022  lipolytic protein G-D-S-L family  30.29 
 
 
321 aa  105  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  32.27 
 
 
424 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0019  putative acetylhydrolase  36.42 
 
 
262 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.211042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0721  hypothetical protein  29.24 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  32.81 
 
 
447 aa  92  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40919  predicted protein  29.88 
 
 
422 aa  86.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47870  predicted protein  24.09 
 
 
402 aa  75.5  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.504417  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  29.47 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  27.57 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44063  predicted protein  26.03 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  30.38 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.32 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  30.56 
 
 
383 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.26 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  30.39 
 
 
228 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  29.35 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  28.75 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  23.88 
 
 
227 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  28.96 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  27.32 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0641  hypothetical protein  28.89 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.726256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  27.5 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  26.92 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  24.91 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  25.74 
 
 
243 aa  62.8  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  28.11 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  26.83 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0603  GDSL family lipase  31.16 
 
 
199 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  0.0431523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1563  lipolytic protein G-D-S-L family  30.51 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  28.49 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3828  GDSL family lipase  25.95 
 
 
375 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  25.13 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  25.39 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  25.62 
 
 
268 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0744  lysophospholipase L1 related esterase  24.72 
 
 
180 aa  49.7  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  24.6 
 
 
238 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  23.7 
 
 
871 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1053  GDSL family lipase  27.23 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  24.19 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2175  lipolytic protein G-D-S-L family  24.62 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5611  lipolytic protein G-D-S-L family  27.69 
 
 
589 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  25.79 
 
 
206 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.92 
 
 
204 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.92 
 
 
204 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.92 
 
 
204 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.92 
 
 
204 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.92 
 
 
204 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  26.49 
 
 
681 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  26.01 
 
 
167 aa  46.2  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  23.63 
 
 
257 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  23.89 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4982  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.46 
 
 
186 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
241 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  24.49 
 
 
189 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4395  lipolytic protein G-D-S-L family  23.2 
 
 
213 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.750338  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5221  hypothetical protein  24.34 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  27.78 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  24.06 
 
 
216 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>