71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2906 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  100 
 
 
167 aa  340  4e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  51.55 
 
 
184 aa  167  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  50 
 
 
165 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  52.94 
 
 
151 aa  155  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  49.38 
 
 
175 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  44.92 
 
 
206 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  49.38 
 
 
182 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  48.8 
 
 
181 aa  147  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  45.06 
 
 
177 aa  140  1e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  44.65 
 
 
174 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  48.61 
 
 
144 aa  137  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  47.77 
 
 
167 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  51.72 
 
 
165 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  47.77 
 
 
155 aa  131  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  45.4 
 
 
178 aa  124  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  45.62 
 
 
159 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  42.55 
 
 
149 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  41.84 
 
 
146 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  35.77 
 
 
160 aa  83.2  1e-15  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  33.55 
 
 
174 aa  80.9  8e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  37.4 
 
 
153 aa  79.3  2e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  37.09 
 
 
153 aa  78.6  4e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  37.59 
 
 
200 aa  73.6  1e-12  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  37.78 
 
 
181 aa  72  3e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  71.2  6e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  34.96 
 
 
190 aa  69.3  2e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  39.01 
 
 
189 aa  69.3  2e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  8.5919e-08  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  34.88 
 
 
197 aa  69.3  2e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  38.1 
 
 
178 aa  68.9  3e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  34.38 
 
 
190 aa  67.8  6e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  35.82 
 
 
162 aa  67.8  7e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  31.06 
 
 
163 aa  65.5  4e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  29.94 
 
 
158 aa  65.1  5e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  38.52 
 
 
151 aa  62  3e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  61.6  5e-09  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  30.34 
 
 
145 aa  60.1  1e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  27.21 
 
 
158 aa  57.4  1e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  34.92 
 
 
176 aa  57  1e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  29.71 
 
 
143 aa  55.8  3e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  31.78 
 
 
164 aa  53.5  1e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  35.51 
 
 
146 aa  51.6  5e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  31.88 
 
 
142 aa  50.4  1e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1602  MOSC domain containing protein  27.81 
 
 
154 aa  48.9  3e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  31.43 
 
 
148 aa  48.9  3e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  31.43 
 
 
148 aa  48.9  3e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  31.78 
 
 
150 aa  48.9  4e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  31.43 
 
 
148 aa  48.1  5e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1266  MOSC domain containing protein  29.45 
 
 
154 aa  47.8  7e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1399  MOSC domain-containing protein  28.19 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.092789  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  31.76 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  28.08 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  28.4 
 
 
201 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  31.17 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  33.79 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  31.76 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49396e-06 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  29.53 
 
 
143 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1607  MOSC  30.07 
 
 
204 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401865  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0303  MOSC domain-containing protein  34.15 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.968814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  30.07 
 
 
147 aa  44.3  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  30.2 
 
 
143 aa  44.3  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1370  MOSC domain protein  29.84 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0654  MOSC domain-containing protein  27.78 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.05439e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  31.13 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.03173e-05 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2359  MOSC domain-containing protein  29.2 
 
 
193 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155986  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  30.19 
 
 
145 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  25.87 
 
 
155 aa  41.2  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  31.73 
 
 
145 aa  40.8  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>