More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2887 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 1181 aa  2357    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.95 
 
 		 1343 aa  199  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.2 
 
 		 510 aa  169  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1094 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  33.59 
 
 		 493 aa  163  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  37.33 
 
 		 1148 aa  155  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  28.24 
 
 		 958 aa  154  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 		 1438 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  28.84 
 
 		 644 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  28.63 
 
 		 546 aa  127  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1224 aa  125  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.43 
 
 		 395 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.48 
 
 		 490 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  31.47 
 
 		 1328 aa  117  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.51 
 
 		 1139 aa  115  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  28.08 
 
 		 959 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  28.87 
 
 		 501 aa  114  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.42 
 
 		 524 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.35 
 
 		 313 aa  107  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.21 
 
 		 323 aa  105  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.21 
 
 		 399 aa  104  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.66 
 
 		 320 aa  98.6  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.43 
 
 		 325 aa  97.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.69 
 
 		 302 aa  94.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.65 
 
 		 192 aa  93.6  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.64 
 
 		 370 aa  93.2  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.72 
 
 		 670 aa  90.9  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.86 
 
 		 1412 aa  90.5  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  28.7 
 
 		 319 aa  89.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  31.63 
 
 		 323 aa  88.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  34.58 
 
 		 299 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  28.7 
 
 		 319 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.01 
 
 		 390 aa  86.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.01 
 
 		 321 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.23 
 
 		 667 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  31.75 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.04 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  30.07 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  31.71 
 
 		 886 aa  82  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.38 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.21 
 
 		 646 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  31.11 
 
 		 321 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.16 
 
 		 180 aa  80.1  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.29 
 
 		 157 aa  79.3  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  28.53 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  30.13 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.73 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  30.03 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  29.19 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  29.44 
 
 		 838 aa  78.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.86 
 
 		 232 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  28.91 
 
 		 286 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  28.69 
 
 		 643 aa  77.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.04 
 
 		 408 aa  77.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  26.76 
 
 		 1133 aa  77.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.31 
 
 		 334 aa  78.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  28.21 
 
 		 646 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.53 
 
 		 220 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.29 
 
 		 1110 aa  76.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  27.94 
 
 		 593 aa  76.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  35.76 
 
 		 199 aa  76.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.28 
 
 		 176 aa  75.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.46 
 
 		 200 aa  75.9  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  22.05 
 
 		 1831 aa  74.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  29.25 
 
 		 316 aa  73.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.49 
 
 		 334 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.34 
 
 		 642 aa  72.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4484  heat domain-containing protein  30.47 
 
 		 246 aa  72.4  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272856  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1399 aa  72  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.91 
 
 		 331 aa  72  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  32.91 
 
 		 331 aa  72  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  31.67 
 
 		 773 aa  72  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.1 
 
 		 208 aa  72  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 492 aa  70.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.38 
 
 		 220 aa  71.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.84 
 
 		 642 aa  70.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.08 
 
 		 641 aa  71.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  32 
 
 		 218 aa  70.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.8 
 
 		 285 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  33.91 
 
 		 1216 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.83 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  32.04 
 
 		 249 aa  69.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  33.87 
 
 		 1194 aa  69.3  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  30.38 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  32.04 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  31.44 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.2 
 
 		 919 aa  68.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 		 1163 aa  68.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.81 
 
 		 831 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 319 aa  67.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.37 
 
 		 220 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.61 
 
 		 408 aa  66.6  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.1 
 
 		 1041 aa  67  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 319 aa  67.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03351  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.14 
 
 		 285 aa  65.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.158445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.82 
 
 		 1357 aa  65.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.08 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.45 
 
 		 1523 aa  65.1  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.64 
 
 		 197 aa  64.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.27 
 
 		 223 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>