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for query gene Plim_2886 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4178  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  49.9 
 
 
1064 aa  900  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5538  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.86 
 
 
1057 aa  855  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300706  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4919  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.67 
 
 
1061 aa  953  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462641  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6557  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.53 
 
 
1063 aa  852  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.169266  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5072  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  50.37 
 
 
1062 aa  973  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193812  normal  0.0596255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1563  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.98 
 
 
1061 aa  847  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0482838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1350  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.71 
 
 
1063 aa  893  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1357  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.94 
 
 
1040 aa  993  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000452964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4788  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  56.98 
 
 
1062 aa  1130  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3044  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.65 
 
 
1075 aa  895  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173145  normal  0.334092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2437  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.92 
 
 
1065 aa  929  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2447  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.47 
 
 
1059 aa  945  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1025  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.31 
 
 
1050 aa  833  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.406583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0505  acriflavine resistance protein B  43.71 
 
 
1049 aa  842  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3154  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.71 
 
 
1049 aa  842  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3208  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.9 
 
 
1050 aa  833  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.10162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.55 
 
 
1049 aa  835  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.40035  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3713  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.96 
 
 
1058 aa  846  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4670  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.77 
 
 
1063 aa  853  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5229  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.48 
 
 
1066 aa  949  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.536808  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3746  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.68 
 
 
1050 aa  844  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756771  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3257  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.63 
 
 
1073 aa  836  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662335  normal  0.89676 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4224  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  50 
 
 
1068 aa  932  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5850  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  53.68 
 
 
1043 aa  1037  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.645492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4535  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  48.68 
 
 
1061 aa  924  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736092  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4149  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.87 
 
 
1055 aa  891  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0394  acriflavine resistance protein B  43.8 
 
 
1049 aa  843  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5504  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.79 
 
 
1089 aa  845  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.42 
 
 
1061 aa  924  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730926  normal  0.35721 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3491  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.76 
 
 
1052 aa  819  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.822048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0648  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.79 
 
 
1089 aa  845  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0479  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.44 
 
 
1064 aa  827  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981936  normal  0.0489217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3092  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.84 
 
 
1056 aa  833  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185291  normal  0.0905875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2449  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.21 
 
 
1063 aa  818  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0901  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.24 
 
 
1062 aa  936  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629732  normal  0.563916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3813  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  51.35 
 
 
1057 aa  905  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353307  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1336  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.05 
 
 
1047 aa  852  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1087  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.98 
 
 
1059 aa  921  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5122  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.95 
 
 
1072 aa  880  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0496  acriflavine resistance protein B  43.71 
 
 
1049 aa  842  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0538  acriflavine resistance protein B  43.71 
 
 
1049 aa  842  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4353  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45 
 
 
1053 aa  831  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703166  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.6 
 
 
1059 aa  929  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0514  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  53.39 
 
 
1069 aa  1069  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0319  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.41 
 
 
1079 aa  917  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0714  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.3 
 
 
1069 aa  918  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3068  acriflavine resistance protein B  43.9 
 
 
1050 aa  833  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.24086e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0668  RND efflux transporter  44.66 
 
 
1039 aa  830  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1591  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  40.31 
 
 
1040 aa  822  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0568  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.8 
 
 
1054 aa  827  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486962  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4054  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.66 
 
 
1057 aa  980  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.422503  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2877  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.51 
 
 
1061 aa  922  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506985  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0376  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.04 
 
 
1049 aa  934  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433431  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4250  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.69 
 
 
1044 aa  834  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3180  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.2 
 
 
1052 aa  875  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0153  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.94 
 
 
1050 aa  818  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1256  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.46 
 
 
1038 aa  979  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.393229  normal  0.26342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1126  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.79 
 
 
1048 aa  828  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.46715e-06  unclonable  4.81916e-08 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4428  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.92 
 
 
1050 aa  827  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.391889  normal  0.149359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2510  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.57 
 
 
1059 aa  946  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307051  normal  0.508426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4508  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.97 
 
 
1069 aa  943  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.229715  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4359  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  50.19 
 
 
1064 aa  895  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.06 
 
 
1063 aa  838  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2879  multidrug efflux protein  43.8 
 
 
1050 aa  832  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.985137 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3931  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.76 
 
 
1057 aa  850  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471961  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3374  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.38 
 
 
1061 aa  951  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5136  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.48 
 
 
1102 aa  948  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.891075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0500  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.91 
 
 
1051 aa  905  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0164  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.75 
 
 
1064 aa  855  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.780381 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4384  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.69 
 
 
1044 aa  835  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3324  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.2 
 
 
1052 aa  876  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1151  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.41 
 
 
1043 aa  978  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3700  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.71 
 
 
1033 aa  816  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.37 
 
 
1048 aa  868  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26926  hitchhiker  0.00468273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2744  RND multidrug efflux transporter MexF  49.38 
 
 
1062 aa  944  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2886  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  100 
 
 
1065 aa  2154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.418369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.11 
 
 
1050 aa  840  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4832  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.24 
 
 
1054 aa  857  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.921314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2563  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  49.39 
 
 
1091 aa  969  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44060  multidrug efflux pump HAE1-family transporter protein  44.39 
 
 
1069 aa  878  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.447353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33870  Multidrug efflux RND transporter MexF  48.71 
 
 
1057 aa  936  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1560  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  41.84 
 
 
1040 aa  840  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1153  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  47.65 
 
 
1058 aa  914  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0328718  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0942  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  49.28 
 
 
1077 aa  958  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.26246  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.9 
 
 
1066 aa  928  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6915  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.82 
 
 
1062 aa  834  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5361  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  50.61 
 
 
1062 aa  975  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4992  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.93 
 
 
1043 aa  880  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729998  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0308  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.81 
 
 
1067 aa  874  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2163  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  46.29 
 
 
1078 aa  940  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0036  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  59.08 
 
 
1048 aa  1261  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_011757  Mchl_4971  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  48.97 
 
 
1069 aa  943  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.155293 
 
 
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NC_012850  Rleg_3352  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  49.48 
 
 
1066 aa  931  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176726  hitchhiker  0.00729316 
 
 
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NC_012850  Rleg_3366  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  47.14 
 
 
1062 aa  963  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0201859 
 
 
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NC_012850  Rleg_3809  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  55.77 
 
 
1056 aa  1122  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0639553  normal 
 
 
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NC_014148  Plim_2295  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  48.81 
 
 
1122 aa  966  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_2294  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  47.81 
 
 
1102 aa  952  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_1920  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.37 
 
 
1044 aa  827  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0960887  normal 
 
 
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NC_013512  Sdel_1165  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.32 
 
 
1042 aa  925  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  2.32541e-05  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001386  cation/multidrug efflux pump  47.02 
 
 
1027 aa  951  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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