196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2861 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  100 
 
 		 313 aa  606  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  51.19 
 
 		 306 aa  266  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  45.11 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  47.6 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  49.83 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  50.32 
 
 		 302 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  50.84 
 
 		 302 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  49.32 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  48.64 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  50.52 
 
 		 640 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  51.19 
 
 		 339 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  48.29 
 
 		 303 aa  231  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  51.19 
 
 		 336 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  51.19 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  51.19 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  51.19 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  51.19 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  51.19 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  51.19 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  45.82 
 
 		 329 aa  225  6e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  47.78 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  48.99 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  45.87 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  47.7 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  45.87 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  48.2 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  44.59 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  49.33 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  45.18 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.55 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  44.56 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  44.56 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  44.26 
 
 		 312 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  46.67 
 
 		 294 aa  211  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.89 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  40.73 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.84 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  44.56 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  44.22 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  45.45 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  45.82 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.39 
 
 		 297 aa  206  6e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  44.08 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  42.05 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  42.32 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 292 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  43.85 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  40.54 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.13 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  42.55 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.94 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  39.38 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  38.61 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  40.07 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.55 
 
 		 584 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 299 aa  132  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  54.29 
 
 		 120 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0122  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  26.79 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  31.65 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  23.08 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  30.93 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  26.71 
 
 		 391 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  25 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5602  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1454  Monosaccharide-transporting ATPase  23.14 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  26.42 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  24.29 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  27.21 
 
 		 451 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  29.06 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2907  Monosaccharide-transporting ATPase  24.54 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0357751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  26.6 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3645  inner-membrane translocator  25.25 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  26.63 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  25.31 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>