More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2828 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
284 aa  581  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  43.44 
 
 
489 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  42.48 
 
 
489 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  42.99 
 
 
489 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  42.15 
 
 
493 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  36.51 
 
 
492 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  41.23 
 
 
424 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  36.93 
 
 
436 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  37.7 
 
 
423 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.42 
 
 
424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  35 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  36.52 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  36.8 
 
 
494 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  33.05 
 
 
489 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  30.88 
 
 
453 aa  129  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  36.15 
 
 
493 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  32.07 
 
 
376 aa  125  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  39.01 
 
 
275 aa  125  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  34.78 
 
 
432 aa  125  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  39.15 
 
 
529 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.8 
 
 
445 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  36.07 
 
 
479 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  34.25 
 
 
447 aa  122  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  37.72 
 
 
484 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  34.98 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  35.25 
 
 
479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  34.63 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  30.2 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  32.48 
 
 
262 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
282 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  31.92 
 
 
277 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  29.21 
 
 
267 aa  118  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  34.18 
 
 
490 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  35.48 
 
 
479 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  32.6 
 
 
264 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  31.23 
 
 
305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  32.92 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 
427 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  32.47 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  33.98 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  33.79 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  30.37 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  32.64 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  32.31 
 
 
513 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  33.19 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06650  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 
418 aa  113  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179039  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  32.03 
 
 
265 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  32.08 
 
 
513 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  31.51 
 
 
267 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  29.54 
 
 
298 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  32.17 
 
 
478 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.91 
 
 
268 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
268 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  35.75 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  30.89 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  27.38 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  33.74 
 
 
443 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  31.98 
 
 
479 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  34.29 
 
 
289 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  30.6 
 
 
262 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  28.46 
 
 
274 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  28.4 
 
 
265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  30.74 
 
 
280 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  28.93 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  33.03 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  33.19 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  29.55 
 
 
264 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45606  predicted protein  28.8 
 
 
366 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166385  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  29.57 
 
 
311 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  30.13 
 
 
272 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  34.72 
 
 
279 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  34.72 
 
 
279 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  29.18 
 
 
291 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  36.61 
 
 
500 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  29.75 
 
 
258 aa  106  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.66 
 
 
278 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  33.6 
 
 
270 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  33.8 
 
 
284 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  30.93 
 
 
320 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  34.26 
 
 
473 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  42.68 
 
 
293 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 
504 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
474 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  29.76 
 
 
286 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  32.33 
 
 
266 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0007  peptidase M48 Ste24p  34.31 
 
 
271 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  31.2 
 
 
487 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  32.35 
 
 
292 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  29.36 
 
 
259 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  31.97 
 
 
480 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.39 
 
 
503 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  31.3 
 
 
271 aa  102  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0007  hypothetical protein  33.89 
 
 
271 aa  102  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  29.33 
 
 
270 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  31.02 
 
 
247 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  29.61 
 
 
270 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  31.06 
 
 
340 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  34.85 
 
 
289 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>