More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2756 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2756  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 474 aa  954    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 459 aa  187  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 469 aa  170  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.1 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  34.75 
 
 		 592 aa  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  33.17 
 
 		 469 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  27.71 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  26.6 
 
 		 461 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.83 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 478 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 484 aa  156  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 489 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.8 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  31.48 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 455 aa  150  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  30.98 
 
 		 357 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 480 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  32.4 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  29.67 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 406 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 614 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  33.22 
 
 		 443 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 456 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  29.01 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  32.84 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.86 
 
 		 466 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  32.84 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  32.84 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 504 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  33.56 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  30.86 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  33.58 
 
 		 482 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 447 aa  144  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  29.1 
 
 		 448 aa  143  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 462 aa  143  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  29.74 
 
 		 470 aa  143  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  28.7 
 
 		 486 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3738  histidine kinase  35.62 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351068  normal  0.0242836 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  32.46 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  32.84 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  32.67 
 
 		 478 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  29.48 
 
 		 455 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  29.48 
 
 		 455 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 461 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  29.63 
 
 		 462 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 515 aa  141  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  28.46 
 
 		 491 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  30.61 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  32.42 
 
 		 475 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 456 aa  140  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  32.88 
 
 		 463 aa  139  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 464 aa  139  8.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 495 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  29.83 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  32.65 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  36.69 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  28.62 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  27.01 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  26.08 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  29.59 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  29.59 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  26.2 
 
 		 457 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  26.2 
 
 		 457 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 462 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 468 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 468 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 468 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 463 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  28.24 
 
 		 468 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 466 aa  136  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  26.53 
 
 		 449 aa  136  9e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  28.49 
 
 		 503 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  28.86 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 524 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 613 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  28.39 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 524 aa  133  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 462 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  30.82 
 
 		 484 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  28.86 
 
 		 484 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  28.86 
 
 		 436 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>