92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2724 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
90 aa  181  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.74 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  38.03 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.93 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.31 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  39.13 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.31 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.31 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  34.34 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  34.52 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  60.53 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2684  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.38 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.388959  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.82 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  41.18 
 
 
104 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.49 
 
 
113 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  35.38 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  38.18 
 
 
179 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  48.21 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  38.18 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  36.92 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.94 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.18 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.72 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3362  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.31 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  39.66 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0702  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.44 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  31.03 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.91 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  42.22 
 
 
98 aa  43.5  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.58 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.34 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
61 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
61 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
61 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
61 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
61 aa  43.5  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.66 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
61 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
61 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
61 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
61 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  37.14 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.82 
 
 
62 aa  43.5  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  38.24 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.91 
 
 
89 aa  42.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.18 
 
 
152 aa  42  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  66.67 
 
 
60 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.913707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.62 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  40.43 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.86 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.33 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  42.22 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  40 
 
 
107 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  36 
 
 
77 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  38.98 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  40 
 
 
59 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  34.21 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  33.96 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
55 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0577  twin arginine-targeting protein translocase  46.15 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.57 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.49 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1079  twin arginine-targeting protein translocase  31.08 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000000000641532  normal  0.697921 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  39.66 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.35 
 
 
90 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1819  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.14 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0539  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.18 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1267  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.74 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0974  Sec-independent protein translocase TatA  51.28 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.17 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
122 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  37.7 
 
 
91 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.74 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  37.7 
 
 
91 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.48 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.71 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  36.11 
 
 
83 aa  40  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  38.27 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  34.38 
 
 
73 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>