More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2700 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  56.24 
 
 		 711 aa  767    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  52.98 
 
 		 711 aa  773    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  52.86 
 
 		 718 aa  758    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  49.57 
 
 		 730 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  54.64 
 
 		 717 aa  757    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  56.07 
 
 		 711 aa  799    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  52.62 
 
 		 723 aa  743    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  47.42 
 
 		 754 aa  673    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  55.38 
 
 		 720 aa  789    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1735  glycogen debranching enzyme GlgX  50.83 
 
 		 691 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  54.07 
 
 		 727 aa  743    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  55.57 
 
 		 757 aa  752    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3793  glycogen debranching enzyme GlgX  51.28 
 
 		 717 aa  687    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  58.76 
 
 		 788 aa  799    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  54.37 
 
 		 727 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  58.97 
 
 		 707 aa  785    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  56.65 
 
 		 714 aa  791    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4230  glycogen debranching protein GlgX  47.89 
 
 		 743 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535158  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  50.15 
 
 		 704 aa  670    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  51.43 
 
 		 692 aa  695    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  55.09 
 
 		 755 aa  745    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  58 
 
 		 706 aa  851    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  54.07 
 
 		 719 aa  739    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  55.67 
 
 		 720 aa  759    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  52.94 
 
 		 688 aa  711    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  53.55 
 
 		 704 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  49.62 
 
 		 739 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  53.54 
 
 		 704 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  55.51 
 
 		 745 aa  766    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  56.72 
 
 		 718 aa  803    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  49.78 
 
 		 733 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  55.81 
 
 		 712 aa  805    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  55.77 
 
 		 716 aa  759    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  58.07 
 
 		 701 aa  788    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  54.14 
 
 		 714 aa  744    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  55.16 
 
 		 729 aa  770    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  54.09 
 
 		 706 aa  742    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  54.29 
 
 		 755 aa  741    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  55.24 
 
 		 712 aa  794    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  51.36 
 
 		 776 aa  786    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  54.95 
 
 		 758 aa  742    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  52.11 
 
 		 691 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  53.16 
 
 		 733 aa  721    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  53.55 
 
 		 704 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  51.48 
 
 		 698 aa  640    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  48.57 
 
 		 708 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  57.27 
 
 		 719 aa  792    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  52.11 
 
 		 716 aa  688    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  56.71 
 
 		 719 aa  783    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  51.9 
 
 		 701 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3681  glycogen debranching protein GlgX  51.13 
 
 		 692 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  48.33 
 
 		 688 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  53.16 
 
 		 738 aa  731    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  49.17 
 
 		 739 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  52.05 
 
 		 728 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  52.47 
 
 		 692 aa  689    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  51.81 
 
 		 692 aa  690    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  55.76 
 
 		 721 aa  798    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  58.32 
 
 		 727 aa  787    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1785  glycogen debranching enzyme GlgX  50.52 
 
 		 691 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  55.38 
 
 		 722 aa  790    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  56.65 
 
 		 714 aa  791    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  66.21 
 
 		 715 aa  903    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  54.49 
 
 		 717 aa  751    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  53.54 
 
 		 691 aa  722    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  54.52 
 
 		 756 aa  741    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  54.74 
 
 		 708 aa  824    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  53.24 
 
 		 688 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  50.49 
 
 		 691 aa  698    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  54.56 
 
 		 717 aa  756    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  56.73 
 
 		 707 aa  814    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  56.67 
 
 		 1537 aa  803    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  51.52 
 
 		 733 aa  691    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4166  glycogen debranching enzyme GlgX  52.11 
 
 		 693 aa  699    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.830683  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  55.12 
 
 		 720 aa  760    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  46.1 
 
 		 766 aa  682    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  55.92 
 
 		 716 aa  761    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  49.18 
 
 		 735 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  54.4 
 
 		 751 aa  785    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1672  glycogen debranching enzyme GlgX  50.37 
 
 		 691 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.574762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  55.09 
 
 		 715 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  53.82 
 
 		 704 aa  734    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  53.9 
 
 		 1464 aa  749    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1670  glycogen debranching enzyme GlgX  49.33 
 
 		 686 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00650022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  54.85 
 
 		 700 aa  729    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  55.37 
 
 		 712 aa  767    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1463  glycogen debranching enzyme GlgX  50 
 
 		 708 aa  681    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.66197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  50.21 
 
 		 697 aa  674    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  51.4 
 
 		 733 aa  753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  54.6 
 
 		 717 aa  752    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  57.31 
 
 		 713 aa  787    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  55.38 
 
 		 720 aa  789    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  56.65 
 
 		 714 aa  791    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  53.85 
 
 		 688 aa  721    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  49.85 
 
 		 702 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1607  glycogen debranching enzyme GlgX  50.37 
 
 		 691 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  55.75 
 
 		 714 aa  784    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  57.23 
 
 		 723 aa  809    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  50.99 
 
 		 718 aa  657    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  53.36 
 
 		 738 aa  732    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>