More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2672 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  49.72 
 
 		 730 aa  657    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  50.41 
 
 		 744 aa  668    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  49.75 
 
 		 862 aa  665    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  47.07 
 
 		 861 aa  689    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  50.35 
 
 		 748 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  47.89 
 
 		 855 aa  674    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  47.18 
 
 		 875 aa  695    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  49.86 
 
 		 751 aa  682    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  46.25 
 
 		 857 aa  702    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  46.83 
 
 		 856 aa  695    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  51.38 
 
 		 878 aa  837    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  48.25 
 
 		 856 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  47.18 
 
 		 861 aa  691    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  44.84 
 
 		 896 aa  707    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  49.06 
 
 		 890 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  46.74 
 
 		 865 aa  686    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  48.87 
 
 		 855 aa  676    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  52.87 
 
 		 755 aa  691    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  50.76 
 
 		 727 aa  687    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  46.08 
 
 		 856 aa  699    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  53.99 
 
 		 746 aa  726    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  47.89 
 
 		 855 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  46.66 
 
 		 858 aa  702    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  50.77 
 
 		 722 aa  682    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  50.86 
 
 		 886 aa  811    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  49.86 
 
 		 743 aa  683    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  47.07 
 
 		 861 aa  666    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  47.42 
 
 		 856 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  50.17 
 
 		 883 aa  800    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  50.86 
 
 		 886 aa  811    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 871 aa  1760    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  48.43 
 
 		 855 aa  647    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  49.72 
 
 		 741 aa  690    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  48.54 
 
 		 723 aa  634  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  48.82 
 
 		 872 aa  629  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  47.7 
 
 		 730 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  46.79 
 
 		 723 aa  626  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  46.25 
 
 		 727 aa  621  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  37.69 
 
 		 876 aa  600  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  42.45 
 
 		 908 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  41.68 
 
 		 877 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  40.89 
 
 		 895 aa  571  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  41.68 
 
 		 877 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  39.3 
 
 		 893 aa  560  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  41.44 
 
 		 914 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  41.57 
 
 		 894 aa  560  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  42.21 
 
 		 906 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  40.52 
 
 		 902 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  42.61 
 
 		 879 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  41.64 
 
 		 918 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  41.89 
 
 		 901 aa  549  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  38.54 
 
 		 882 aa  545  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  38.16 
 
 		 894 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  41.04 
 
 		 879 aa  536  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  41.01 
 
 		 900 aa  535  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  40.25 
 
 		 885 aa  533  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  37.93 
 
 		 910 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  37.12 
 
 		 939 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  36.02 
 
 		 887 aa  515  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  40.05 
 
 		 881 aa  502  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  34.13 
 
 		 874 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  33.88 
 
 		 874 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  35.48 
 
 		 584 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  29.88 
 
 		 646 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  28.66 
 
 		 622 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  26.63 
 
 		 636 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  21 
 
 		 741 aa  173  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  35.01 
 
 		 664 aa  172  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  32.62 
 
 		 538 aa  167  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  26.44 
 
 		 637 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  29.64 
 
 		 560 aa  160  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.34 
 
 		 755 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.34 
 
 		 755 aa  158  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  38.69 
 
 		 576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32 
 
 		 778 aa  157  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.37 
 
 		 778 aa  157  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  33.1 
 
 		 1103 aa  156  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  27.08 
 
 		 573 aa  147  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  33.75 
 
 		 328 aa  147  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.1 
 
 		 757 aa  146  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  27.9 
 
 		 647 aa  144  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  35.91 
 
 		 594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  26.76 
 
 		 1086 aa  140  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  34.8 
 
 		 754 aa  137  9e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  33.54 
 
 		 585 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  34.8 
 
 		 581 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  33.44 
 
 		 569 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  33.23 
 
 		 571 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.96 
 
 		 750 aa  126  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  34.48 
 
 		 581 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  33.23 
 
 		 562 aa  126  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  34.48 
 
 		 581 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  34.15 
 
 		 585 aa  126  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  27.75 
 
 		 427 aa  126  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  34.17 
 
 		 581 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  31.66 
 
 		 593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 		 588 aa  121  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 		 581 aa  120  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  30.58 
 
 		 578 aa  120  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  31.66 
 
 		 582 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>