More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2671 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  54.29 
 
 
861 aa  883    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  53.97 
 
 
865 aa  883    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  53.87 
 
 
855 aa  847    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  53.87 
 
 
855 aa  847    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  53.2 
 
 
857 aa  882    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  42.48 
 
 
878 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  53.87 
 
 
856 aa  905    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  100 
 
 
896 aa  1812    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  54.07 
 
 
890 aa  869    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  53.62 
 
 
856 aa  877    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  54.07 
 
 
862 aa  833    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  53.96 
 
 
858 aa  893    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  53.34 
 
 
872 aa  794    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  53.26 
 
 
855 aa  841    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  50.17 
 
 
856 aa  825    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  54.16 
 
 
856 aa  870    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  54.4 
 
 
861 aa  885    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  53.78 
 
 
875 aa  893    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  54.14 
 
 
861 aa  865    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  54.5 
 
 
855 aa  905    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  45.3 
 
 
871 aa  731    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  41.17 
 
 
894 aa  623  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  40.8 
 
 
886 aa  615  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  40.8 
 
 
886 aa  615  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  40.99 
 
 
883 aa  615  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  38.68 
 
 
876 aa  610  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  40.61 
 
 
902 aa  608  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  41.56 
 
 
914 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  40.63 
 
 
918 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  41.15 
 
 
879 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  38.91 
 
 
895 aa  599  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  40.49 
 
 
877 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  40.61 
 
 
877 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  40.02 
 
 
908 aa  587  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  41.72 
 
 
910 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  40.54 
 
 
901 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  37.24 
 
 
894 aa  582  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  40.77 
 
 
900 aa  585  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  37.86 
 
 
882 aa  581  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  38.47 
 
 
906 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  41.14 
 
 
879 aa  571  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  37.32 
 
 
893 aa  568  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  38.41 
 
 
939 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  36.82 
 
 
887 aa  551  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  37.73 
 
 
885 aa  549  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  39.37 
 
 
881 aa  545  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  42.21 
 
 
746 aa  538  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  41.26 
 
 
743 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  43.82 
 
 
755 aa  504  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  39.12 
 
 
730 aa  496  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  40.03 
 
 
727 aa  488  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  40.27 
 
 
741 aa  488  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  40.54 
 
 
751 aa  485  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  40.27 
 
 
744 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  41.44 
 
 
722 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  33.77 
 
 
874 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  33.53 
 
 
874 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  41.05 
 
 
748 aa  475  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  40 
 
 
723 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  38.06 
 
 
730 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  38.37 
 
 
723 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  38.29 
 
 
727 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  37.18 
 
 
664 aa  219  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  31.02 
 
 
646 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  31.6 
 
 
622 aa  211  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  31.43 
 
 
584 aa  208  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  30.07 
 
 
636 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  30.43 
 
 
560 aa  205  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  31.54 
 
 
573 aa  202  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  31.85 
 
 
637 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  35.31 
 
 
778 aa  198  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  30.25 
 
 
647 aa  196  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  34.49 
 
 
538 aa  195  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  34.7 
 
 
778 aa  194  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  24.32 
 
 
741 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  34.78 
 
 
757 aa  187  7e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  34.89 
 
 
755 aa  184  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.81 
 
 
755 aa  183  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  40.54 
 
 
1103 aa  180  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  38.07 
 
 
581 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  37.05 
 
 
569 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  36.75 
 
 
571 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  38.12 
 
 
581 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  36.91 
 
 
593 aa  174  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  33.75 
 
 
328 aa  174  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  37.81 
 
 
581 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  37.81 
 
 
581 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  37.19 
 
 
579 aa  171  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  36.1 
 
 
576 aa  171  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  28.29 
 
 
1086 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  38.6 
 
 
584 aa  168  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  30.31 
 
 
427 aa  167  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  37.22 
 
 
585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
593 aa  165  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  34.89 
 
 
588 aa  165  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  34.52 
 
 
725 aa  164  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  36.56 
 
 
562 aa  163  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  33.33 
 
 
597 aa  162  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
581 aa  161  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
594 aa  160  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>