256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2666 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 178 aa  363  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  50.29 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.93 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44 
 
 		 182 aa  154  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.05 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.13 
 
 		 172 aa  151  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.75 
 
 		 182 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.16 
 
 		 184 aa  150  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  50.29 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.25 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  43.35 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.2 
 
 		 181 aa  147  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  42.53 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  43.35 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.09 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  46.29 
 
 		 180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.81 
 
 		 181 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  42.77 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  42.11 
 
 		 227 aa  141  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  41.62 
 
 		 172 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  42.29 
 
 		 183 aa  140  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.38 
 
 		 181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.62 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  39.77 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  35.84 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  40.46 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.88 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  40.46 
 
 		 177 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.77 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.2 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  48.39 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  37.57 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  42.37 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.26 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  39.05 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.27 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.27 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.06 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.93 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.85 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  39.33 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  40.91 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  36.42 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  35.26 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  42 
 
 		 409 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  35.26 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.95 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.95 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 		 189 aa  98.6  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.31 
 
 		 179 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  38.31 
 
 		 179 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  38.31 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  32.93 
 
 		 188 aa  97.4  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.45 
 
 		 182 aa  97.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  34.97 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  34.44 
 
 		 192 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  33.14 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.59 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  32.57 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  32.57 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  37.42 
 
 		 189 aa  91.3  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  33.14 
 
 		 184 aa  90.9  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.26 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  32.57 
 
 		 213 aa  85.5  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  29.45 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  29.75 
 
 		 183 aa  84.3  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.05 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  29.11 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  27.71 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.11 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.27 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.64 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  31.74 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.25 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.43 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  31.65 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  28.48 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  26.42 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.14 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.98 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  32.24 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  30.11 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.65 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.67 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.93 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  31.68 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.56 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  31.93 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  31.33 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  32.34 
 
 		 198 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.74 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  31.37 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.67 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.33 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.56 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.08 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.33 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>