More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2626 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  100 
 
 
176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  47.06 
 
 
166 aa  152  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  58.49 
 
 
161 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  58.49 
 
 
161 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  58.49 
 
 
163 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  44.51 
 
 
159 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  59.05 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  47.66 
 
 
166 aa  121  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  42.22 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  47.37 
 
 
172 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  53.21 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  40.28 
 
 
206 aa  112  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  45.93 
 
 
148 aa  111  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  38.37 
 
 
151 aa  111  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  34.5 
 
 
161 aa  111  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  44.64 
 
 
209 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  51.38 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  45.79 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  38.82 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  40 
 
 
143 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  48.62 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  45.31 
 
 
146 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  36.63 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  47.71 
 
 
183 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  47.71 
 
 
149 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  42.86 
 
 
151 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 
171 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  40.52 
 
 
175 aa  105  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  35.96 
 
 
190 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  41.18 
 
 
156 aa  104  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  41.18 
 
 
156 aa  104  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  38.67 
 
 
177 aa  104  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  38.82 
 
 
168 aa  104  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  38.76 
 
 
168 aa  103  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  37.84 
 
 
188 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  46.79 
 
 
167 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  43.22 
 
 
201 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  35.88 
 
 
154 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  46.79 
 
 
146 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  42.34 
 
 
182 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  38.24 
 
 
162 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  39.04 
 
 
178 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  39.04 
 
 
178 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  37.65 
 
 
165 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  39.04 
 
 
178 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  39.04 
 
 
178 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  39.04 
 
 
178 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  39.04 
 
 
178 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  39.04 
 
 
178 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 
175 aa  102  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  39.04 
 
 
178 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  36.78 
 
 
175 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  42.07 
 
 
161 aa  101  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  36.69 
 
 
167 aa  101  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  42.59 
 
 
183 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  41.44 
 
 
182 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  36.56 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  36.56 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  44.95 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  32.98 
 
 
171 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  35.8 
 
 
166 aa  99  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  38.55 
 
 
154 aa  99  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  38.89 
 
 
181 aa  99  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  42.86 
 
 
163 aa  98.6  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  35.06 
 
 
175 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  41.88 
 
 
242 aa  98.6  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  34.73 
 
 
159 aa  98.2  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  45.05 
 
 
172 aa  98.2  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  43.75 
 
 
178 aa  98.2  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  37.21 
 
 
161 aa  97.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  36.63 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  44.74 
 
 
160 aa  97.8  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  40 
 
 
139 aa  97.4  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  43.8 
 
 
130 aa  97.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  36.36 
 
 
157 aa  97.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  47.32 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  39.41 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  42.98 
 
 
130 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  36.96 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  36.57 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  36.53 
 
 
150 aa  97.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  38 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  34.13 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  40.37 
 
 
172 aa  96.7  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  37.23 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  43.86 
 
 
225 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  35.33 
 
 
141 aa  96.7  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  32.35 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  39.82 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  45.38 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  40 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  47.32 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  42.98 
 
 
231 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  34.71 
 
 
167 aa  95.9  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  42.11 
 
 
220 aa  95.5  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  36 
 
 
164 aa  95.1  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  40 
 
 
139 aa  95.5  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  41.51 
 
 
136 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  43.09 
 
 
178 aa  94.4  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
147 aa  94.4  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>