More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2603 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2603  enolase  100 
 
 		 425 aa  867    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  68.97 
 
 		 429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  68.97 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  69.21 
 
 		 429 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5032  enolase  66.51 
 
 		 426 aa  568  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 		 430 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  66.83 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  67.38 
 
 		 430 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  66.19 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  64.85 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 430 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  67.14 
 
 		 423 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  64.99 
 
 		 424 aa  559  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  65.16 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 431 aa  554  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  64.86 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  64.44 
 
 		 430 aa  554  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  65.8 
 
 		 426 aa  551  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 		 433 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  68.26 
 
 		 426 aa  553  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  64.76 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  63.01 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  63.01 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  63.9 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  65.09 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  63.42 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2476  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 		 430 aa  544  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.846458  normal  0.0424446 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 		 433 aa  541  1e-153  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  62.23 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  62.74 
 
 		 433 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 431 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  61.86 
 
 		 437 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  65.88 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 		 429 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1972  phosphopyruvate hydratase  61.63 
 
 		 437 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  65.71 
 
 		 428 aa  539  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  65.07 
 
 		 430 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 431 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 		 429 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 		 430 aa  538  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0278  phosphopyruvate hydratase  62.33 
 
 		 437 aa  540  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301795 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 		 425 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  65 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  61.32 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  64.99 
 
 		 422 aa  537  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 		 427 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 437 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  62.62 
 
 		 427 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  63.48 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  63.48 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2161  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 		 430 aa  532  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.844141  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0347  phosphopyruvate hydratase  61.63 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0639  phosphopyruvate hydratase  63.72 
 
 		 430 aa  532  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.397631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  64.05 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 		 422 aa  534  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  62.86 
 
 		 427 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  61.94 
 
 		 431 aa  533  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  63.88 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  63.21 
 
 		 431 aa  534  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  62.23 
 
 		 428 aa  534  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  63.72 
 
 		 425 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 		 427 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  62.62 
 
 		 427 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  63.18 
 
 		 428 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1184  Phosphopyruvate hydratase  63.68 
 
 		 426 aa  529  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  61.67 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1424  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 		 424 aa  529  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 		 427 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 		 431 aa  531  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 		 425 aa  529  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  62.29 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0186  phosphopyruvate hydratase  61.57 
 
 		 437 aa  530  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  64.11 
 
 		 429 aa  528  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  62.62 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  65.31 
 
 		 424 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 		 431 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5238  enolase  64.27 
 
 		 425 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>