More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2551 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 876 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 876 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 876 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2551  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 870 aa  1788    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 876 aa  672    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 875 aa  637    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 876 aa  641    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 865 aa  650    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 892 aa  696    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 876 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 875 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 874 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  42.86 
 
 		 876 aa  677    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 875 aa  665    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 875 aa  638    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 876 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 875 aa  664    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 876 aa  671    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 875 aa  665    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 862 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 863 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 860 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 876 aa  672    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 874 aa  639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 876 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 876 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0998  alanyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 875 aa  648    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.932608  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 876 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 865 aa  645    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 876 aa  640    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 876 aa  672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 876 aa  674    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 874 aa  650    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 860 aa  639    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 880 aa  654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 875 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 865 aa  632  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 864 aa  634  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 874 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 874 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 874 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 875 aa  629  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 874 aa  631  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 874 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 875 aa  630  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 874 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 867 aa  626  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 872 aa  628  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 874 aa  625  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 874 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 874 aa  628  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 874 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 884 aa  628  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 874 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 869 aa  629  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 874 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 869 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 874 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 879 aa  622  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 871 aa  624  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 882 aa  625  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 897 aa  625  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 874 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 881 aa  624  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 874 aa  625  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 874 aa  623  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 897 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 874 aa  625  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 897 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 892 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 874 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 878 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 874 aa  622  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 865 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 874 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 874 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 874 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 877 aa  619  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 865 aa  619  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 876 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 874 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 874 aa  616  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 868 aa  615  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 877 aa  619  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 874 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 865 aa  617  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 874 aa  618  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 860 aa  616  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 874 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 874 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 874 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 874 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 874 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 896 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 874 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 888 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 903 aa  608  1e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 874 aa  611  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 881 aa  610  1e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>