102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2531 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2531  transposase  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  95.72 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  47.51 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  53.93 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  51.38 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  47.8 
 
 		 180 aa  158  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  51.48 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  45.6 
 
 		 178 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  50.3 
 
 		 179 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  46.7 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  43.96 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  50.59 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  44.97 
 
 		 179 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  47.9 
 
 		 164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  44.81 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  44.97 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  48.21 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  43.02 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  45.56 
 
 		 176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  45.14 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  45.98 
 
 		 163 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  47.34 
 
 		 165 aa  141  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  47.34 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  47.34 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  46.06 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  46.75 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  46.15 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  43.2 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  47.31 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  42.6 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  41.51 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  51.18 
 
 		 133 aa  131  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  42.76 
 
 		 161 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  43.75 
 
 		 161 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  35.88 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  37.34 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  26.51 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  28.37 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  30.56 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  25.53 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  33.12 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  28.3 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  32.21 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  27.21 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  27.15 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  29.17 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  28.17 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  35.19 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  29.79 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  29.8 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  25.93 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  24.66 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  24.48 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  25.52 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  27.86 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  26.9 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  28.78 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  26.49 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  28.66 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  28.47 
 
 		 151 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  30.36 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  26.09 
 
 		 236 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  25.69 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  23.97 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  28.18 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  29 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  26.24 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  24.79 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  29 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  28.32 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  22.92 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  56.76 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  24 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  25.97 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  24.48 
 
 		 160 aa  45.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  23.94 
 
 		 234 aa  44.7  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  30.17 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  24.82 
 
 		 236 aa  44.7  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  25.15 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  23.4 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  26.71 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3203  hypothetical protein  23.17 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.936957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  25.85 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  23.4 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  22.58 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  22.93 
 
 		 310 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  26.79 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  22.78 
 
 		 319 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  29.17 
 
 		 320 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  33.8 
 
 		 76 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  22.46 
 
 		 250 aa  42  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  25.16 
 
 		 219 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  20.59 
 
 		 304 aa  42  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  27.18 
 
 		 212 aa  41.6  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  26.28 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  23.78 
 
 		 232 aa  41.2  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  59.26 
 
 		 321 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>