119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2512 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 394 aa  805    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  26.75 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  24.82 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.75 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  21.1 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.08 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  22.86 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  22.22 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.33 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  19.65 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.93 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  21.99 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  24.88 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  20.43 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  20.36 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  22.84 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  22.42 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  23.17 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  23.17 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  21.72 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  23.76 
 
 		 394 aa  67  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.32 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  22.14 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 		 1096 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  20.85 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  20.86 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  20.23 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.82 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  21.28 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  22.42 
 
 		 1111 aa  64.7  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  25.26 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 1061 aa  63.2  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  21.76 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  22.28 
 
 		 1061 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  23 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.81 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  27.91 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  22.2 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  21.55 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  21.27 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  21.84 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  20.05 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  24.13 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  25.1 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  19.9 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  21.52 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  21.65 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  23.48 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  20.86 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  23.9 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  32.58 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  21.2 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  33.77 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  33.77 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  25.14 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.6 
 
 		 392 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  27.78 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  22.03 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  30.49 
 
 		 498 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  20.41 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  22.69 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  25.46 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  22.14 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  31.63 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  21.41 
 
 		 792 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  26.63 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.23 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 356 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  23.15 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  23.55 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  23.35 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  29.11 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.17 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  19.6 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  25.95 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  27.27 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  20.36 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  29.11 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  20.23 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  19.64 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  27.59 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  27.81 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  32.17 
 
 		 337 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  22.75 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  21.64 
 
 		 360 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  27.59 
 
 		 389 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  27.59 
 
 		 389 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>