218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2495 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 		 514 aa  1049    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  44.77 
 
 		 511 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  31.71 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  32.93 
 
 		 472 aa  226  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  30.8 
 
 		 466 aa  223  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  32.66 
 
 		 463 aa  217  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  31.77 
 
 		 473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  30.81 
 
 		 482 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  31.1 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  30.9 
 
 		 472 aa  190  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  32.08 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  31.56 
 
 		 480 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  31.88 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  31.88 
 
 		 484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  30.92 
 
 		 480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  32.48 
 
 		 484 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  30.73 
 
 		 443 aa  183  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  30.69 
 
 		 488 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  31.91 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  30.92 
 
 		 480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  32.2 
 
 		 474 aa  180  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  31.79 
 
 		 500 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  32.75 
 
 		 465 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  31.97 
 
 		 482 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  31.9 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  31.76 
 
 		 486 aa  176  7e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  29.96 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  28.88 
 
 		 451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  31.95 
 
 		 484 aa  172  9e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  30.45 
 
 		 488 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  29.88 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  30.06 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  31.06 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  30.67 
 
 		 486 aa  171  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  30.32 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  30.41 
 
 		 479 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  31.03 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  30.58 
 
 		 502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  31.52 
 
 		 486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  31.36 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  32.09 
 
 		 484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  32.18 
 
 		 476 aa  163  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  29.56 
 
 		 477 aa  163  7e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  29.81 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  31.97 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  30.36 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  29.21 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  29.6 
 
 		 476 aa  160  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  28.63 
 
 		 476 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  31.32 
 
 		 487 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  29.3 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  28.42 
 
 		 476 aa  159  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  31.1 
 
 		 487 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  31.32 
 
 		 488 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  32.83 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  27.39 
 
 		 963 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  29.31 
 
 		 475 aa  157  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  32.74 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  29.96 
 
 		 478 aa  156  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  27.54 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  30.13 
 
 		 476 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  29.17 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  31.12 
 
 		 486 aa  154  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  30.06 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  30.37 
 
 		 477 aa  151  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  30.89 
 
 		 472 aa  151  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  29.78 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  29.94 
 
 		 485 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  33.26 
 
 		 484 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  31.18 
 
 		 475 aa  150  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  29.72 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  29.51 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  31.58 
 
 		 988 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  29.93 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  26.45 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  29.87 
 
 		 485 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  28.33 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  30.1 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  28.63 
 
 		 462 aa  141  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  30.15 
 
 		 485 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  29.76 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  29.5 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  27.98 
 
 		 395 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  28.36 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  29.45 
 
 		 485 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  28.96 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  29.45 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  30.67 
 
 		 399 aa  135  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3903  release factor H-coupled RctB family protein  27.74 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  28.84 
 
 		 408 aa  131  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  29.84 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  29.28 
 
 		 398 aa  130  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  27.12 
 
 		 514 aa  130  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  28.6 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  29.42 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  28.24 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  30.47 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  30.37 
 
 		 405 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  30.47 
 
 		 405 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  29.27 
 
 		 493 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>