23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2482 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  839    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1154  hypothetical protein  35.08 
 
 		 435 aa  173  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4488  hypothetical protein  30.18 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2372  hypothetical protein  31.37 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3187  hypothetical protein  30.67 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0947704 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1600  hypothetical protein  34.41 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.406561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0657  hypothetical protein  34.59 
 
 		 411 aa  147  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3510  hypothetical protein  29.22 
 
 		 419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.376537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2153  kinase  28.57 
 
 		 363 aa  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0264  GTP-binding protein  27.27 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  30.92 
 
 		 650 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  31.67 
 
 		 614 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.8 
 
 		 637 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  21.33 
 
 		 444 aa  53.1  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  19.54 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  27.78 
 
 		 635 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  30.33 
 
 		 629 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  25.4 
 
 		 192 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0880  GTPase domain-containing protein  25.82 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1955  GTPase domain-containing protein  26.9 
 
 		 164 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.387211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14190  uncharacterized protein associated with GTPases  26.19 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.32 
 
 		 529 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2984  GTPase associated putative protein/domain-like protein  23.48 
 
 		 168 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.22109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>