More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2403 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2403  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
533 aa  1085    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784107  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0937  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 
518 aa  226  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2106  Ppx/GppA phosphatase  28.79 
 
 
510 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000089745  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  30.37 
 
 
519 aa  190  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  27.77 
 
 
521 aa  187  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  26.55 
 
 
527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  27.19 
 
 
521 aa  183  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  28.79 
 
 
514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  27.24 
 
 
519 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0465  exopolyphosphatase-like protein  27.57 
 
 
507 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.655214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  28.97 
 
 
519 aa  176  9e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  29.56 
 
 
508 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  28.84 
 
 
570 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  28.6 
 
 
505 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  26.49 
 
 
519 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  28.41 
 
 
534 aa  163  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  27.61 
 
 
505 aa  163  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  28.18 
 
 
513 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  27.15 
 
 
550 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  27.92 
 
 
539 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  27.24 
 
 
519 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  27.56 
 
 
511 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  28.1 
 
 
553 aa  156  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  27.31 
 
 
545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  27.31 
 
 
545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  27.87 
 
 
549 aa  153  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  28.21 
 
 
531 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  26.1 
 
 
544 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  28.6 
 
 
523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  27.59 
 
 
531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  25.63 
 
 
549 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  27.59 
 
 
532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  27.85 
 
 
548 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  26.56 
 
 
513 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  26.1 
 
 
513 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  26.65 
 
 
497 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  27.74 
 
 
510 aa  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  25.85 
 
 
531 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  27.6 
 
 
531 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  27.31 
 
 
511 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.81 
 
 
544 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  24.95 
 
 
502 aa  139  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.38 
 
 
544 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  27.18 
 
 
501 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  25.54 
 
 
501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  28.6 
 
 
526 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  25.95 
 
 
513 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  28.28 
 
 
550 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  26.88 
 
 
557 aa  134  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  26.82 
 
 
500 aa  133  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  25.95 
 
 
513 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  25.95 
 
 
513 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  25.95 
 
 
513 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  27.83 
 
 
506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  25.95 
 
 
513 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  26.64 
 
 
545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  25.95 
 
 
513 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  25.95 
 
 
513 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  25.95 
 
 
513 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  29.25 
 
 
501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  28.29 
 
 
500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  25.79 
 
 
513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.86 
 
 
502 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  29.87 
 
 
506 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  29.98 
 
 
501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  22.86 
 
 
502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  26.64 
 
 
500 aa  130  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  25.37 
 
 
526 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  25.37 
 
 
513 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  28.29 
 
 
500 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  28.08 
 
 
500 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  25.37 
 
 
526 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  25.37 
 
 
526 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  25.37 
 
 
526 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  26.34 
 
 
516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  28.32 
 
 
500 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  24.18 
 
 
502 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  27.03 
 
 
497 aa  125  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  27.75 
 
 
508 aa  124  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  28.26 
 
 
500 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  26.47 
 
 
500 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  29.58 
 
 
508 aa  124  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  26.46 
 
 
501 aa  123  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  25.54 
 
 
511 aa  123  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  25.05 
 
 
511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  24.95 
 
 
501 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  25.39 
 
 
500 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  25.51 
 
 
520 aa  120  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  25.18 
 
 
519 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  25.18 
 
 
519 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  23.65 
 
 
507 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  24.94 
 
 
519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  24.68 
 
 
513 aa  118  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  24.32 
 
 
509 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0336  exopolyphosphatase-like protein  24.05 
 
 
504 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  25.93 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  26.55 
 
 
491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  24.05 
 
 
509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  25.05 
 
 
500 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  26 
 
 
508 aa  114  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>