45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2361 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  100 
 
 		 1113 aa  2279    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0202  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.18 
 
 		 1149 aa  99.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0859  ATP-dependent nuclease subunit AddB  21.94 
 
 		 1170 aa  97.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1060  ATP-dependent nuclease subunit B  21.42 
 
 		 1171 aa  96.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1296  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.33 
 
 		 1171 aa  97.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1141  ATP-dependent nuclease subunit B  21.42 
 
 		 1171 aa  96.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1244  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.33 
 
 		 1171 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1040  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.23 
 
 		 1171 aa  95.5  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4149  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.33 
 
 		 1171 aa  94.7  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1038  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.4 
 
 		 1171 aa  94  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1192  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.46 
 
 		 1171 aa  92.8  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.102099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1219  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.33 
 
 		 1171 aa  92  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1040  ATP-dependent nuclease subunit AddB  21.4 
 
 		 1171 aa  88.2  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20152  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.31 
 
 		 1049 aa  81.6  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0670  ATP-dependent nuclease subunit B  25.61 
 
 		 1171 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.62 
 
 		 1121 aa  77.4  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.36 
 
 		 1146 aa  75.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0024  ATP-dependent nuclease, subunit B  22.99 
 
 		 1158 aa  75.5  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.199779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0024  ATP-dependent nuclease subunit B  23.42 
 
 		 1158 aa  75.5  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  24.41 
 
 		 1149 aa  74.7  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.91 
 
 		 1140 aa  74.3  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  27.51 
 
 		 1151 aa  74.3  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1485  ATP-dependent nuclease subunit B  25.21 
 
 		 1172 aa  74.3  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1277  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.56 
 
 		 1165 aa  72.8  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  31.03 
 
 		 1029 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1032  ATP-dependent nuclease, subunit B  21.22 
 
 		 1158 aa  67.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.30431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1142  ATP-dependent nuclease subunit B  20.3 
 
 		 1124 aa  66.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2833  ATP-dependent nuclease subunit B  24.89 
 
 		 1218 aa  64.3  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  22.54 
 
 		 1186 aa  63.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.38 
 
 		 1048 aa  63.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1482  ATP-dependent nuclease, subunit B  20.8 
 
 		 1159 aa  62  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0985  ATP-dependent nuclease subunit AddB  19.46 
 
 		 1157 aa  62  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0966  ATP-dependent nuclease subunit AddB  19.46 
 
 		 1157 aa  62  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1415  UvrD-like DNA helicase, C terminal  28.95 
 
 		 1155 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0049  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.19 
 
 		 1260 aa  55.5  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  19.26 
 
 		 1077 aa  55.5  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.29 
 
 		 986 aa  55.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  29.41 
 
 		 1171 aa  55.1  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0308  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.81 
 
 		 1161 aa  53.9  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1438  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.32 
 
 		 1029 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140223  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2077  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.99 
 
 		 1169 aa  52  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.07 
 
 		 994 aa  51.6  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0003  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.67 
 
 		 1099 aa  50.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  27.52 
 
 		 984 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1049 aa  47.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>