More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2355 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  100 
 
 		 159 aa  319  8e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  43.92 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  39.24 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  41.22 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  38 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  40 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  40.71 
 
 		 208 aa  100  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  35.86 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  44.29 
 
 		 305 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.44 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  38.56 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  44.76 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  36.91 
 
 		 153 aa  97.4  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  41.78 
 
 		 138 aa  97.1  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  37.33 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  37.66 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  37.91 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  34.21 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  37.33 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  36.67 
 
 		 147 aa  94.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  41.26 
 
 		 290 aa  94  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  41.4 
 
 		 320 aa  94  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  38 
 
 		 153 aa  94  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.93 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  37.91 
 
 		 300 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  39.22 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  39.04 
 
 		 281 aa  90.9  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 145 aa  90.9  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  37.91 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  37.01 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  36 
 
 		 297 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  38.61 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.24 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  37.24 
 
 		 307 aa  88.2  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.62 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  37.06 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.97 
 
 		 180 aa  87.4  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  33.11 
 
 		 145 aa  87  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  37.76 
 
 		 288 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  37.42 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  35.71 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  37.27 
 
 		 314 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  39.58 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  37.97 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  41.96 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  36.81 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  37.58 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  36.49 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  31.08 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  36.73 
 
 		 283 aa  84.3  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  36.55 
 
 		 170 aa  84  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  36.55 
 
 		 170 aa  84  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  38.57 
 
 		 156 aa  84  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  34.78 
 
 		 169 aa  83.6  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  37.5 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  34.67 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.67 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  35.14 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.8 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  37.93 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  39.58 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  35.1 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  33.33 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  34.23 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.48 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  42.21 
 
 		 304 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  38.19 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  34.72 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 274 aa  80.5  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  34.03 
 
 		 287 aa  80.5  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.51 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  33.99 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  34.87 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  34 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  34.25 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  35.03 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  33.1 
 
 		 289 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>