59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2351 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  825    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  34.81 
 
 
385 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  31.18 
 
 
392 aa  173  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  33.72 
 
 
388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  31.2 
 
 
428 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  31.34 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  30.45 
 
 
487 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  30.89 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  30.03 
 
 
423 aa  126  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  33.6 
 
 
415 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  30.99 
 
 
422 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  30.34 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  28.85 
 
 
414 aa  120  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  28.83 
 
 
477 aa  116  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  31.74 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  30.87 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  27.01 
 
 
411 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  31.21 
 
 
383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  28.26 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  27.74 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  32.34 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  26.52 
 
 
438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  31.36 
 
 
403 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  30.9 
 
 
372 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  30 
 
 
369 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  30 
 
 
412 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  30 
 
 
412 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  27.42 
 
 
407 aa  103  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  30.28 
 
 
382 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  31.61 
 
 
416 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  30.66 
 
 
358 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  29.38 
 
 
399 aa  98.2  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  30.86 
 
 
399 aa  96.3  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  26.37 
 
 
396 aa  96.3  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  27.88 
 
 
401 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  31.58 
 
 
411 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  27.41 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  22.92 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  25.84 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  24.65 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  26.98 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  21.94 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  24.15 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  22.79 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  25.81 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  26.09 
 
 
420 aa  67  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  21.95 
 
 
433 aa  65.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  21.83 
 
 
431 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  25.15 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  23.54 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  23.06 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  23.53 
 
 
474 aa  60.8  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  25.48 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  23.81 
 
 
394 aa  56.6  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58562  predicted protein  35.11 
 
 
279 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0813846  normal  0.776229 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2419  hypothetical protein  34 
 
 
212 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2298  hypothetical protein  33 
 
 
212 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.08 
 
 
268 aa  43.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>