175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2286 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 509 aa  1027    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  36.51 
 
 		 491 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  37.71 
 
 		 490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  35.76 
 
 		 488 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  36.28 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  32.03 
 
 		 495 aa  259  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  32.78 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  32.91 
 
 		 469 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  33.61 
 
 		 469 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  33.05 
 
 		 479 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  33.91 
 
 		 474 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  33.13 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  32.92 
 
 		 472 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  33.68 
 
 		 467 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  32.49 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  27.74 
 
 		 482 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  31.22 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  28.99 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  28.99 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  30.13 
 
 		 473 aa  206  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  29.35 
 
 		 473 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  31.28 
 
 		 475 aa  202  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  28.63 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  30.85 
 
 		 470 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  30.82 
 
 		 459 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  29.29 
 
 		 473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  29.23 
 
 		 473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  29.02 
 
 		 473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  29.14 
 
 		 473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  28.81 
 
 		 473 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  28.81 
 
 		 473 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  28.81 
 
 		 473 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  30.69 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  32.37 
 
 		 446 aa  190  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  32.37 
 
 		 446 aa  190  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  29.73 
 
 		 460 aa  187  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  34.07 
 
 		 476 aa  186  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  29.18 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  32.49 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  28.73 
 
 		 456 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  29.67 
 
 		 488 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  30.6 
 
 		 463 aa  174  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  31.06 
 
 		 482 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  29.07 
 
 		 482 aa  173  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  29.94 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  26.91 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  31.16 
 
 		 475 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  29.26 
 
 		 471 aa  163  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  29.23 
 
 		 470 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  29.86 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  26.37 
 
 		 441 aa  159  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  29.03 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  30.67 
 
 		 473 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  29.08 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  27.73 
 
 		 488 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  22.9 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  22.8 
 
 		 463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  22.8 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  29.28 
 
 		 488 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  23.24 
 
 		 466 aa  146  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  23.24 
 
 		 466 aa  146  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  22.9 
 
 		 466 aa  146  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  22.8 
 
 		 463 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  29.19 
 
 		 493 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  22.06 
 
 		 466 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  22.61 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  24.02 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  23.32 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  26.16 
 
 		 465 aa  138  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  28.73 
 
 		 421 aa  137  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  26.95 
 
 		 454 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  26.92 
 
 		 460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  29.74 
 
 		 452 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  27.8 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  27.87 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  26.74 
 
 		 482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  28.54 
 
 		 447 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  26.44 
 
 		 463 aa  120  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  30.04 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  26.98 
 
 		 469 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  27.35 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  25.1 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  28.81 
 
 		 451 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  28.81 
 
 		 451 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  28.81 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  28.28 
 
 		 469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  27.56 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  24.95 
 
 		 476 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  26.15 
 
 		 423 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  30.24 
 
 		 454 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  32.24 
 
 		 491 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  27.11 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  28.43 
 
 		 479 aa  98.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  25.66 
 
 		 462 aa  89.7  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  24.72 
 
 		 487 aa  87  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  28.57 
 
 		 589 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  26.48 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  27.6 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  24.34 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  26.05 
 
 		 553 aa  63.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>