More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2247 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 246 aa  510  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  53.85 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  54.04 
 
 		 240 aa  258  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  49.79 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  47.28 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  28.87 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  30.3 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  26.8 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  30.05 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  27.41 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  31.32 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1540  methyltransferase type 12  27.54 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  28.44 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  26.05 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  30.41 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  23.36 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  23.36 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  25.83 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  30.48 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.19 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  27.56 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  34.75 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0142  hypothetical protein  26.49 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.04 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.47 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.89 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.13 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  37.04 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.79 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  30.06 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  24.02 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.12 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  24.24 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2496  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.14 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.18 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  33.56 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  34.83 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.44 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  30.17 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  31.73 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  22.54 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  31.73 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1030  methyltransferase type 12  29.36 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.76 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.01 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  31.37 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  31.37 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  31.37 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.37 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  31.37 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  27.68 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  26.95 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.31 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.92 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.63 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.92 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.61 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  27.04 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  30.84 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  31.37 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.63 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  33.62 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  30.22 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.48 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>