More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2237 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
343 aa  707    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.829729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
313 aa  321  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  46.67 
 
 
312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.78 
 
 
325 aa  299  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.27 
 
 
316 aa  299  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.62 
 
 
319 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  48.22 
 
 
305 aa  296  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  47.9 
 
 
305 aa  296  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.7 
 
 
306 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  47.62 
 
 
317 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  44.55 
 
 
347 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.9 
 
 
321 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  46.03 
 
 
323 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
302 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  42.9 
 
 
318 aa  289  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  46.73 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  46.93 
 
 
302 aa  285  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.1 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  45.62 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  46.53 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  46.28 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.7 
 
 
341 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  45.65 
 
 
331 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.38 
 
 
324 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  45.78 
 
 
318 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  48.29 
 
 
326 aa  279  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  46.67 
 
 
350 aa  279  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.31 
 
 
337 aa  278  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.97 
 
 
315 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.99 
 
 
356 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.71 
 
 
314 aa  277  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  47.71 
 
 
310 aa  277  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  45.93 
 
 
313 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.01 
 
 
313 aa  276  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.57 
 
 
309 aa  276  6e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  45.83 
 
 
331 aa  275  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  45.86 
 
 
350 aa  275  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.77 
 
 
310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  45.95 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  46.28 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.9 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  47.45 
 
 
306 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  45.95 
 
 
309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  45.95 
 
 
309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  49.33 
 
 
359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  45.26 
 
 
342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.43 
 
 
354 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  45.95 
 
 
309 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  45.95 
 
 
309 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  48.91 
 
 
303 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  43.55 
 
 
314 aa  272  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  45.6 
 
 
316 aa  272  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  42.86 
 
 
315 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.09 
 
 
314 aa  271  8.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.77 
 
 
319 aa  271  9e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.13 
 
 
351 aa  271  9e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.91 
 
 
332 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.51 
 
 
321 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  45.95 
 
 
309 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  47.12 
 
 
306 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  47.22 
 
 
310 aa  270  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  42.52 
 
 
309 aa  270  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2421  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.6 
 
 
315 aa  270  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.12 
 
 
335 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  42.63 
 
 
457 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  45.63 
 
 
309 aa  269  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  49.65 
 
 
309 aa  268  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.67 
 
 
343 aa  268  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  46.1 
 
 
316 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  46.6 
 
 
316 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  45.82 
 
 
320 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1331  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.73 
 
 
324 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280532  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  48.42 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  45.82 
 
 
320 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.15 
 
 
320 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  45.54 
 
 
317 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.5 
 
 
330 aa  265  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.77 
 
 
305 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.13 
 
 
318 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.14 
 
 
327 aa  265  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  45.82 
 
 
320 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  45.82 
 
 
320 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  45.45 
 
 
303 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1405  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  44.41 
 
 
342 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0567323  hitchhiker  0.00186052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  44.41 
 
 
340 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.94 
 
 
328 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  44.75 
 
 
328 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  45.69 
 
 
317 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.54 
 
 
324 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  44.86 
 
 
324 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  43.6 
 
 
327 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.29 
 
 
329 aa  262  6.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  43.23 
 
 
310 aa  261  8e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  45.37 
 
 
317 aa  261  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.73 
 
 
319 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.58 
 
 
312 aa  261  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  46.05 
 
 
302 aa  261  1e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>