More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2235 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2235  CBS domain containing protein  100 
 
 		 439 aa  886    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  33.03 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  30.56 
 
 		 420 aa  193  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  32.72 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  33.53 
 
 		 426 aa  189  8e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  38.19 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  32.36 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  32.36 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  32.36 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  33.94 
 
 		 430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  32.37 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  32.92 
 
 		 477 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  29.63 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  28.73 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  38.78 
 
 		 284 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  31.01 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  32.53 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  32.26 
 
 		 467 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  37.54 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  39.13 
 
 		 287 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  40.6 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  40.07 
 
 		 439 aa  177  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 435 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  34.98 
 
 		 421 aa  176  8e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  39.13 
 
 		 287 aa  176  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  34.91 
 
 		 443 aa  176  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  34.34 
 
 		 443 aa  176  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  32.48 
 
 		 461 aa  176  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  30.28 
 
 		 437 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  31.3 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  37.87 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  35.62 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  37.63 
 
 		 291 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  34.57 
 
 		 425 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  35.49 
 
 		 455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  28.8 
 
 		 446 aa  173  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  31.09 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  29.67 
 
 		 443 aa  173  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  39.58 
 
 		 284 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  35.05 
 
 		 425 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  28.6 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  36.77 
 
 		 292 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  36.68 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  28.67 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 		 284 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  29.4 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  41.39 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  35.44 
 
 		 435 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 		 464 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  39.41 
 
 		 432 aa  169  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  28.67 
 
 		 431 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  35.97 
 
 		 291 aa  169  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  30.11 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  31.17 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  36.2 
 
 		 292 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.84 
 
 		 292 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  38.32 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  34.74 
 
 		 323 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  29.3 
 
 		 438 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  34.39 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  33.43 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  31.17 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  31.37 
 
 		 490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  34.84 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  35.74 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0376  CBS domain containing protein  26.12 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  29.32 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  28.92 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3536  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 		 422 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  30.98 
 
 		 435 aa  167  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 		 430 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  33.57 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  35.15 
 
 		 293 aa  166  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  40.42 
 
 		 258 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  33.23 
 
 		 454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  28.44 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  39.09 
 
 		 371 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  31.58 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 		 291 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 		 291 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  35.21 
 
 		 291 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  28.44 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  33.44 
 
 		 465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 		 291 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  38.58 
 
 		 285 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  34.05 
 
 		 283 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  35.51 
 
 		 281 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  31.66 
 
 		 470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  37.35 
 
 		 276 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  31.58 
 
 		 455 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.13 
 
 		 291 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  32.94 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3902  CBS domain containing protein  35.6 
 
 		 425 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  35.13 
 
 		 285 aa  163  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 291 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 291 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  35.13 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>